90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3508 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  56.31 
 
 		 845 aa  850    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  73.06 
 
 		 887 aa  1249    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  54.41 
 
 		 865 aa  884    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  100 
 
 		 879 aa  1763    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  74.23 
 
 		 887 aa  1254    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  74.26 
 
 		 889 aa  1224    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  51.73 
 
 		 850 aa  737    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  80.79 
 
 		 878 aa  1330    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  95.05 
 
 		 889 aa  1670    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  51.56 
 
 		 849 aa  768    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  96.06 
 
 		 889 aa  1682    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  52.95 
 
 		 840 aa  806    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  96.83 
 
 		 884 aa  1689    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  71.43 
 
 		 897 aa  1210    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  43.07 
 
 		 836 aa  623  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  42.49 
 
 		 836 aa  624  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  43.31 
 
 		 872 aa  544  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  30.02 
 
 		 817 aa  299  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  28.38 
 
 		 817 aa  281  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  27.47 
 
 		 817 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  28.38 
 
 		 836 aa  266  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  30.11 
 
 		 825 aa  239  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  28.28 
 
 		 820 aa  239  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  29.71 
 
 		 826 aa  219  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  28.21 
 
 		 819 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  28.07 
 
 		 850 aa  214  7e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  30.72 
 
 		 819 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  28.36 
 
 		 849 aa  211  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  27.29 
 
 		 800 aa  211  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  30.78 
 
 		 819 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  28.06 
 
 		 821 aa  204  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  28.97 
 
 		 804 aa  203  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  29.23 
 
 		 821 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  29.15 
 
 		 815 aa  197  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  29.41 
 
 		 800 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  28.2 
 
 		 820 aa  191  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  25.28 
 
 		 847 aa  190  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  25.6 
 
 		 803 aa  190  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  25.31 
 
 		 813 aa  188  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  27.03 
 
 		 821 aa  183  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  25.21 
 
 		 855 aa  182  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  27.64 
 
 		 793 aa  178  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  25.81 
 
 		 847 aa  178  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  27.87 
 
 		 870 aa  177  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  28.94 
 
 		 802 aa  175  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  26.51 
 
 		 821 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  25.72 
 
 		 866 aa  171  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  27.43 
 
 		 837 aa  147  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  23.93 
 
 		 929 aa  136  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  25.53 
 
 		 843 aa  127  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  30.89 
 
 		 819 aa  125  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 845 aa  124  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 		 839 aa  124  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  32.24 
 
 		 820 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  25.72 
 
 		 846 aa  109  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  22.62 
 
 		 858 aa  107  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  21.26 
 
 		 857 aa  93.2  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  21.09 
 
 		 851 aa  91.3  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  22.42 
 
 		 858 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  29.19 
 
 		 795 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  22.8 
 
 		 867 aa  81.3  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  25 
 
 		 842 aa  79.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  21.95 
 
 		 849 aa  79  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  26.85 
 
 		 753 aa  78.6  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  27.22 
 
 		 843 aa  78.6  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 		 842 aa  78.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 		 842 aa  77.4  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  22.67 
 
 		 846 aa  77  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  25.75 
 
 		 841 aa  76.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  22.51 
 
 		 850 aa  75.5  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  29.86 
 
 		 795 aa  70.1  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  29.86 
 
 		 795 aa  68.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  21.27 
 
 		 868 aa  68.2  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  22.03 
 
 		 849 aa  67.4  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  20.75 
 
 		 853 aa  65.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  22.58 
 
 		 884 aa  65.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  21.95 
 
 		 857 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  23 
 
 		 855 aa  62  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  20.47 
 
 		 855 aa  60.1  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  23.12 
 
 		 852 aa  55.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  22.31 
 
 		 835 aa  53.9  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  22.31 
 
 		 835 aa  53.9  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  27.92 
 
 		 855 aa  52.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  23.55 
 
 		 877 aa  50.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  19.39 
 
 		 408 aa  50.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  29.71 
 
 		 877 aa  48.1  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  19.94 
 
 		 844 aa  47.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  21.45 
 
 		 848 aa  45.8  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  23.93 
 
 		 390 aa  45.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  20 
 
 		 856 aa  44.7  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>