More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2049 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  73.36 
 
 		 866 aa  1303    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  99.08 
 
 		 867 aa  1759    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  98.5 
 
 		 867 aa  1746    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 867 aa  1770    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  99.31 
 
 		 867 aa  1760    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 857 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  33.26 
 
 		 847 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 855 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 852 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 861 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 875 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 861 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 861 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 861 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 861 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 861 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 		 871 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 849 aa  392  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 869 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  32.39 
 
 		 827 aa  347  4e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 891 aa  321  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 890 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 872 aa  301  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 890 aa  300  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 842 aa  300  8e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  29.41 
 
 		 895 aa  299  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 874 aa  299  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 896 aa  298  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 890 aa  299  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 869 aa  298  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 843 aa  289  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 868 aa  290  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  27.8 
 
 		 922 aa  290  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  29.96 
 
 		 884 aa  287  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  26.74 
 
 		 899 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 909 aa  283  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 876 aa  283  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 896 aa  283  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 879 aa  283  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 909 aa  283  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 883 aa  280  6e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 883 aa  280  6e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 841 aa  280  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  28.21 
 
 		 880 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 950 aa  279  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 883 aa  278  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 924 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 924 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 924 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  27.27 
 
 		 893 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 853 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 836 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 853 aa  269  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 853 aa  269  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 853 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 925 aa  267  7e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 928 aa  267  8e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  28.77 
 
 		 936 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  29.61 
 
 		 839 aa  266  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  29.61 
 
 		 853 aa  264  6.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 930 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 930 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 930 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 817 aa  262  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 838 aa  261  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 927 aa  260  7e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 855 aa  257  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 1055 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 800 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 855 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 869 aa  254  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 904 aa  250  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 924 aa  249  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 884 aa  249  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 912 aa  248  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 904 aa  248  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 904 aa  247  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 904 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 965 aa  243  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 944 aa  243  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 937 aa  239  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  27.77 
 
 		 834 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  28.09 
 
 		 866 aa  234  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 941 aa  234  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 941 aa  234  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 894 aa  234  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 941 aa  234  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 903 aa  232  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 907 aa  233  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 873 aa  231  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 991 aa  229  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 935 aa  228  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 910 aa  228  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 873 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 897 aa  222  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 935 aa  222  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 894 aa  221  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 886 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 893 aa  219  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  30.13 
 
 		 709 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>