More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1249 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  71.72 
 
 
5255 aa  2156    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  57.16 
 
 
3254 aa  926    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  43.51 
 
 
2847 aa  1090    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  35.92 
 
 
2333 aa  656    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  53.36 
 
 
6768 aa  1193    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  56.18 
 
 
1601 aa  915    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  49.67 
 
 
2090 aa  991    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  37.75 
 
 
1827 aa  658    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  38.12 
 
 
1832 aa  669    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.44 
 
 
1909 aa  642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  51.65 
 
 
7279 aa  1492    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  50.76 
 
 
4930 aa  1364    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.12 
 
 
3874 aa  1348    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  44.96 
 
 
2719 aa  1018    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  39.73 
 
 
2066 aa  1063    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  41.29 
 
 
2232 aa  738    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.23 
 
 
2078 aa  953    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  46.15 
 
 
2060 aa  882    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  47.23 
 
 
3508 aa  1412    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  50.68 
 
 
1924 aa  1350    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  58.21 
 
 
1143 aa  913    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.8 
 
 
2551 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
1874 aa  723    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  40.4 
 
 
1656 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.96 
 
 
1822 aa  665    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  38.84 
 
 
1587 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  56.45 
 
 
3158 aa  1119    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  48.01 
 
 
3148 aa  746    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  46.01 
 
 
1955 aa  706    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  50.73 
 
 
3463 aa  1392    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  55.53 
 
 
1593 aa  862    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  49.23 
 
 
4607 aa  1044    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  37.51 
 
 
3101 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1789 aa  3474    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  44.12 
 
 
4840 aa  1138    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.2 
 
 
1816 aa  1323    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  53.67 
 
 
2126 aa  1204    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  50.56 
 
 
3493 aa  1023    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  46.28 
 
 
2081 aa  711    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.5 
 
 
2136 aa  677    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  52.18 
 
 
1548 aa  803    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  64.48 
 
 
3494 aa  1972    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  72.77 
 
 
1831 aa  2340    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  43.91 
 
 
3449 aa  1280    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.09 
 
 
5400 aa  1303    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  38.87 
 
 
3693 aa  677    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  57.42 
 
 
1584 aa  962    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.85 
 
 
1804 aa  643    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  46.44 
 
 
1820 aa  1349    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  32.68 
 
 
1349 aa  647    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  48.91 
 
 
1573 aa  733    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  46.71 
 
 
1077 aa  687    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.9 
 
 
7110 aa  1540    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  46.58 
 
 
2020 aa  984    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  38.78 
 
 
2230 aa  716    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  44.2 
 
 
4882 aa  1198    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  59.83 
 
 
5154 aa  1717    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  48.33 
 
 
1071 aa  731    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  46.93 
 
 
2367 aa  978    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  41.53 
 
 
4111 aa  1063    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  50 
 
 
1867 aa  1099    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  52.84 
 
 
3355 aa  1407    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  50.48 
 
 
1602 aa  1064    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  38.87 
 
 
3693 aa  677    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  50.51 
 
 
3711 aa  1426    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.42 
 
 
1837 aa  1029    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  45.19 
 
 
2113 aa  1154    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  45.05 
 
 
3930 aa  1370    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  50 
 
 
1101 aa  800    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  48.63 
 
 
2108 aa  1107    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  38.63 
 
 
3676 aa  669    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  48.22 
 
 
2846 aa  925    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  39.04 
 
 
3696 aa  641    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  39.65 
 
 
2890 aa  721    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  38.15 
 
 
1805 aa  669    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.13 
 
 
1349 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  50.78 
 
 
2374 aa  738    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  44.32 
 
 
3670 aa  1121    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  44.89 
 
 
4575 aa  1095    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.54 
 
 
1559 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  46.03 
 
 
2107 aa  1141    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  52.05 
 
 
2966 aa  1421    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  37.86 
 
 
1559 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  52.86 
 
 
3408 aa  1433    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.7 
 
 
3092 aa  797    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  53.21 
 
 
7210 aa  1557    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  37.23 
 
 
3176 aa  656    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  38.96 
 
 
3702 aa  679    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  49.44 
 
 
2376 aa  718    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  46.81 
 
 
4080 aa  1273    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.56 
 
 
1939 aa  786    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  51.25 
 
 
1305 aa  847    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  46.89 
 
 
2277 aa  1322    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  46.59 
 
 
2024 aa  684    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  54.65 
 
 
3033 aa  815    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  38.26 
 
 
2225 aa  642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  37.95 
 
 
3679 aa  657    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  52.28 
 
 
1114 aa  896    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  54.08 
 
 
4151 aa  1249    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  39.35 
 
 
3281 aa  912    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>