More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1429 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 
668 aa  1344  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.79067e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.44 
 
 
810 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.14 
 
 
818 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.31 
 
 
1056 aa  105  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 
878 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.72 
 
 
1022 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 
927 aa  98.6  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 
543 aa  94  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.11 
 
 
784 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.09 
 
 
988 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 
4079 aa  92.4  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 
366 aa  91.7  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.77 
 
 
1676 aa  91.3  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 
833 aa  91.3  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.19 
 
 
1056 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.14 
 
 
2240 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.5 
 
 
1737 aa  89.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 
758 aa  89.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
279 aa  87.4  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 
750 aa  85.5  3e-15  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
409 aa  84.7  6e-15  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
568 aa  84.3  7e-15  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  1.62187e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 
356 aa  84  8e-15  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  29.27 
 
 
573 aa  83.6  1e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
405 aa  83.2  2e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.23 
 
 
265 aa  83.2  2e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.26196e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
265 aa  83.2  2e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
288 aa  82.4  3e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
399 aa  82  3e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 
649 aa  80.9  7e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 
392 aa  80.9  7e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 
804 aa  80.1  1e-13  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 
1421 aa  80.1  1e-13  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  27.2 
 
 
750 aa  79.7  2e-13  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
409 aa  79.7  2e-13  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 
376 aa  79  3e-13  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.5 
 
 
746 aa  79  3e-13  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 
1276 aa  78.2  4e-13  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.64 
 
 
632 aa  78.2  4e-13  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
486 aa  77.8  6e-13  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 
361 aa  77.8  6e-13  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31061e-06 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  22.71 
 
 
3301 aa  77.4  7e-13  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.99 
 
 
462 aa  77  1e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 
329 aa  76.6  1e-12  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.05 
 
 
1694 aa  76.6  1e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  25.6 
 
 
267 aa  77  1e-12  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.43988e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  33.73 
 
 
208 aa  75.9  2e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.92317e-07  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 
371 aa  75.9  2e-12  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.99 
 
 
320 aa  75.9  2e-12  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 
409 aa  75.9  2e-12  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 
1297 aa  75.5  3e-12  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 
591 aa  75.1  4e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.57665e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.38 
 
 
397 aa  74.3  6e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
280 aa  73.9  8e-12  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 
3172 aa  73.9  9e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 
301 aa  73.2  1e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  26.63 
 
 
573 aa  73.2  1e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.69 
 
 
639 aa  73.6  1e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.2774e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
583 aa  73.6  1e-11  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 
301 aa  73.6  1e-11  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  30.46 
 
 
338 aa  73.6  1e-11  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.57 
 
 
340 aa  73.6  1e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.88 
 
 
594 aa  73.2  1e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
311 aa  73.6  1e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  26.35 
 
 
295 aa  72.8  2e-11  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 
643 aa  72.4  2e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.74385e-07  hitchhiker  4.66075e-06 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 
685 aa  72.4  2e-11  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.98 
 
 
837 aa  72.4  3e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 
617 aa  72.4  3e-11  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  20.58 
 
 
562 aa  72  3e-11  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  30 
 
 
936 aa  71.6  4e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
344 aa  72  4e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
344 aa  72  4e-11  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 
605 aa  72  4e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  23.62 
 
 
473 aa  71.6  4e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 
375 aa  71.6  5e-11  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 
1049 aa  71.2  5e-11  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
1827 aa  71.2  5e-11  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 
448 aa  71.2  6e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.54 
 
 
582 aa  71.2  6e-11  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.96 
 
 
364 aa  70.9  8e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.93 
 
 
878 aa  70.9  8e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
828 aa  70.5  9e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 
670 aa  70.1  1e-10  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 
357 aa  70.1  1e-10  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  23.09 
 
 
1069 aa  70.5  1e-10  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
357 aa  70.1  1e-10  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  4.5072e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
750 aa  70.5  1e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  30.56 
 
 
681 aa  70.5  1e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  26.99 
 
 
832 aa  70.1  1e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.06 
 
 
738 aa  70.5  1e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  27.33 
 
 
820 aa  70.1  1e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.12 
 
 
784 aa  70.1  1e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  21.38 
 
 
1979 aa  70.1  1e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
265 aa  69.7  2e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.21078e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 
934 aa  69.3  2e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
323 aa  69.7  2e-10  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  27.17 
 
 
269 aa  69.3  2e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
243 aa  69.3  2e-10  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  24.57 
 
 
1101 aa  69.3  2e-10  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>