More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0828 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  100 
 
 
240 aa  491  1e-138  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.98283e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  56.49 
 
 
342 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  54.96 
 
 
342 aa  147  2e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.3444e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  58.2 
 
 
346 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  48.3 
 
 
341 aa  141  1e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.54936e-13  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  64.6 
 
 
202 aa  139  5e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  1.5981e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  55.12 
 
 
246 aa  138  9e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  55.12 
 
 
246 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  48 
 
 
342 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  52.71 
 
 
347 aa  130  1e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  6.88808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  53.45 
 
 
349 aa  128  7e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  45.95 
 
 
476 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  52.29 
 
 
170 aa  114  1e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  56.88 
 
 
210 aa  114  2e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  47.01 
 
 
424 aa  112  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  3.25506e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  41.77 
 
 
215 aa  112  7e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  39.41 
 
 
215 aa  111  8e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  47.71 
 
 
274 aa  111  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  43.18 
 
 
224 aa  111  1e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  41.86 
 
 
221 aa  111  1e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  1.64638e-06  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  43.61 
 
 
223 aa  110  2e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  41.86 
 
 
221 aa  110  2e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  43.61 
 
 
223 aa  110  2e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  5.24971e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  41.09 
 
 
223 aa  110  2e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  43.61 
 
 
223 aa  110  2e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  43.65 
 
 
222 aa  110  2e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  45.37 
 
 
265 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.04581e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  44.54 
 
 
234 aa  109  4e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  6.24175e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  44.54 
 
 
218 aa  109  4e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  44.54 
 
 
234 aa  109  4e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  2.2944e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  44.54 
 
 
218 aa  109  4e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  5.76333e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  44.54 
 
 
234 aa  109  4e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  44.54 
 
 
218 aa  109  4e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  44.54 
 
 
218 aa  109  4e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  44.54 
 
 
234 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  46.72 
 
 
242 aa  108  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  45.9 
 
 
228 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  50 
 
 
255 aa  108  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  44.04 
 
 
269 aa  108  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  41.73 
 
 
226 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  44.19 
 
 
183 aa  108  7e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  41.67 
 
 
224 aa  108  7e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
223 aa  108  8e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
223 aa  108  8e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  43.2 
 
 
170 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  47.41 
 
 
285 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  45 
 
 
391 aa  106  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  41.67 
 
 
181 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  42.2 
 
 
269 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.66415e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  42.2 
 
 
307 aa  105  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  43.09 
 
 
370 aa  105  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  45.08 
 
 
225 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  39.47 
 
 
458 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.88548e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  40.37 
 
 
267 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  44.63 
 
 
181 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  31.22 
 
 
248 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  40.37 
 
 
278 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.49372e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  44.26 
 
 
187 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  46.56 
 
 
333 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  42.4 
 
 
169 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  45.61 
 
 
192 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  39.45 
 
 
266 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  45.61 
 
 
192 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  43.8 
 
 
173 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  45.38 
 
 
181 aa  101  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  45.61 
 
 
230 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  43.09 
 
 
211 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  43.59 
 
 
208 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  39.53 
 
 
258 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  42.06 
 
 
303 aa  99.4  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  43.9 
 
 
194 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  44.07 
 
 
193 aa  99.4  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  43.59 
 
 
172 aa  99.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  43.8 
 
 
177 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  36.43 
 
 
220 aa  99.4  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  43.59 
 
 
194 aa  99  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  43.59 
 
 
194 aa  99  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  43.8 
 
 
177 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  44.35 
 
 
226 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  39.83 
 
 
175 aa  98.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
177 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  41.28 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.16 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  39.52 
 
 
188 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  43.12 
 
 
217 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  39.53 
 
 
365 aa  96.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  5.21128e-05  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  39.53 
 
 
365 aa  96.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  34.16 
 
 
208 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  34.16 
 
 
207 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  40 
 
 
208 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  44.63 
 
 
174 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  46.03 
 
 
319 aa  96.3  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  33.54 
 
 
208 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  40.34 
 
 
205 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  43.24 
 
 
150 aa  96.3  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  45 
 
 
205 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  4.4472e-09 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
177 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  42.15 
 
 
177 aa  95.5  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3747  NLP/P60  42.15 
 
 
166 aa  95.5  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.60725  normal  0.715068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>