More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0816 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 230 aa  460  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  58.77 
 
 		 224 aa  254  5e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  50 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  48.05 
 
 		 231 aa  208  6e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  47.64 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  46.05 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  48.03 
 
 		 228 aa  204  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  46.75 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  47.19 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  43.43 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  43.72 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  49.12 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  47.41 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  44.1 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  44.98 
 
 		 237 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  45.02 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  44.78 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  45.81 
 
 		 226 aa  191  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  44.1 
 
 		 228 aa  188  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  48.89 
 
 		 235 aa  187  8e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  42.66 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  41.63 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  42.92 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  43.61 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  47.81 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  48.67 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  39.65 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  48.67 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  41.7 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  44.59 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  39.65 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  46.64 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  38.84 
 
 		 280 aa  175  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  46 
 
 		 227 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  41.2 
 
 		 236 aa  174  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  38.8 
 
 		 272 aa  174  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  46.5 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  41.48 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  46.88 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  41.99 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  40.43 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  49.75 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  40.43 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  39.13 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  47.53 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  42.06 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  45.41 
 
 		 275 aa  170  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  43.69 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  41.56 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  39.39 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  41.81 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  38.33 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  46.31 
 
 		 219 aa  167  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  40.69 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  39.57 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  46.75 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  39.83 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  47.3 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  40.26 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  41.3 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  37.99 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  39.13 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  38.56 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  42.79 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  42.72 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  46 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  42.54 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  40.59 
 
 		 242 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  38.33 
 
 		 228 aa  165  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  37.99 
 
 		 238 aa  165  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  41.52 
 
 		 216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  39.13 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  39.32 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  40 
 
 		 248 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  40.68 
 
 		 234 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  40.26 
 
 		 228 aa  164  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  39.13 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  41.59 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  38.53 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  41.59 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  41.31 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  37.83 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  40.25 
 
 		 234 aa  161  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  38.86 
 
 		 271 aa  161  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  37.93 
 
 		 237 aa  161  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  40.69 
 
 		 228 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  40.71 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  40.25 
 
 		 234 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  40.25 
 
 		 234 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  38.22 
 
 		 269 aa  160  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  38.16 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  40.25 
 
 		 234 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  40.61 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03298  alanine racemase domain protein  43.63 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  43.29 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  47.62 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  41.86 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  37.89 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  37.99 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>