More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1601 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  304  2.0000000000000002e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  75.33 
 
 
150 aa  235  2e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  64 
 
 
150 aa  200  5e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  50 
 
 
162 aa  160  7e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  48.65 
 
 
152 aa  150  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  50.68 
 
 
162 aa  149  8.999999999999999e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  48.65 
 
 
152 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  48.65 
 
 
152 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  48.65 
 
 
152 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  48.65 
 
 
152 aa  148  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  48.65 
 
 
152 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  48.65 
 
 
152 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  48.65 
 
 
152 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  48.65 
 
 
152 aa  148  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  48.65 
 
 
152 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  47.97 
 
 
152 aa  148  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  51.03 
 
 
149 aa  144  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  45.83 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  47.22 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  45.89 
 
 
147 aa  137  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  46.15 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  46.15 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  45.45 
 
 
166 aa  130  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  40.41 
 
 
146 aa  122  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  41.67 
 
 
145 aa  113  8.999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 
154 aa  107  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 
165 aa  102  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.81 
 
 
164 aa  97.8  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  37.93 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.13 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  33.56 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  32.67 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  35.17 
 
 
156 aa  77  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
141 aa  77  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.59 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  30 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0631  UspA family nucleotide-binding protein  31.97 
 
 
146 aa  72  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  27.21 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.72 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.22 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  30.52 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  29.8 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.28 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.2 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  29.53 
 
 
290 aa  67.4  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  32.88 
 
 
141 aa  67  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  28.87 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  32.12 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  34.23 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  30.2 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  34.97 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  29.94 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  30.2 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  29.94 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  30.34 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  28.57 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
140 aa  63.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  32.19 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  30.49 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  29.73 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  30.67 
 
 
166 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19770  universal stress protein UspA-like protein  27.03 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.078994  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  33.12 
 
 
187 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  31.29 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  27.22 
 
 
173 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  34.01 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  29.08 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  31.08 
 
 
297 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  28.67 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 
156 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  31.43 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 
155 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  32 
 
 
146 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  29.61 
 
 
151 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  32.43 
 
 
173 aa  60.1  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  32.19 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  30.57 
 
 
169 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  29.19 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  27.03 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1791  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.03 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  32.17 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  26.23 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0340  UspA family nucleotide-binding protein  31.47 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000238748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>