More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1028 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  435  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 235 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  40.5 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  43.59 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4647  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 245 aa  102  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 232 aa  101  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 246 aa  99.4  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 238 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 228 aa  99.4  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  31.25 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  32.73 
 
 		 232 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 234 aa  95.1  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  39.91 
 
 		 233 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  30.77 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 228 aa  91.7  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 228 aa  92  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 240 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  33.19 
 
 		 275 aa  92  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 251 aa  90.9  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  36.73 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  37.09 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 236 aa  89.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2015  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 242 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  34.91 
 
 		 244 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 224 aa  89  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 256 aa  88.6  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  35.16 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 239 aa  87.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4215  transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162899  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 237 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  32.71 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  24.87 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  32.72 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  42.76 
 
 		 252 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  32.77 
 
 		 241 aa  85.9  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  32.72 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3949  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 216 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  36.76 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4862  transcriptional regulator, GntR family  32.13 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556045  normal  0.353938 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 		 238 aa  85.5  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 221 aa  85.5  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  30.41 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 233 aa  85.1  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  36.5 
 
 		 219 aa  85.1  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 217 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 214 aa  84.7  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  37.95 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>