More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3011 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 235 aa  482  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  59.03 
 
 		 222 aa  264  8.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  39.11 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  37.44 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  36.76 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  36.54 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  37.19 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  32.37 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  33.82 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  34.13 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  29.6 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  28.86 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  28.7 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  28.7 
 
 		 389 aa  79.3  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  31.86 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30.35 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  26.7 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  31.4 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  31.19 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  31.06 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  25.11 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  24.69 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  28.02 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  26.05 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  28.1 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  34.86 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  34.9 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  33.98 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  33.98 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  27.43 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  29.31 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  29.27 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  25.36 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  33.11 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  29.83 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  32.1 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  32.1 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  24.87 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  32.1 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  33.01 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  28.78 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  27.14 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  39.22 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  31.2 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  30.36 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  32.91 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  30.36 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  30.36 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  27.6 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  28.9 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  28.9 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  28.9 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  28.9 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  27.04 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  28.9 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  28.9 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  28.89 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  25.24 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  26.19 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  26.17 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  31.15 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1017  isochorismatase hydrolase  29.11 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  29.94 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  27.5 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  29.47 
 
 		 187 aa  62  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  28.57 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  39.77 
 
 		 174 aa  62  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  27.32 
 
 		 176 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  27.18 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  27.73 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  29.01 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  32.06 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  29.01 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  32.48 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  29.01 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  29.01 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  29.01 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  28.32 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  29.91 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  23.81 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  27.96 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  30.36 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  28.5 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  27.52 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>