296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0088 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  89.29 
 
 		 448 aa  822    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  908    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  71.6 
 
 		 439 aa  610  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  52.79 
 
 		 429 aa  471  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  37.84 
 
 		 436 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  33.79 
 
 		 429 aa  286  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  30.21 
 
 		 437 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  29.72 
 
 		 435 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0829  hypothetical protein  31.29 
 
 		 448 aa  197  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.476785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  30.25 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  29.32 
 
 		 453 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  27.85 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  31.22 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  28.25 
 
 		 432 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  28.83 
 
 		 427 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  27.48 
 
 		 427 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1642  hypothetical protein  32.03 
 
 		 437 aa  170  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1133  hypothetical protein  28.4 
 
 		 450 aa  170  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3973  hypothetical protein  28.26 
 
 		 450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0831495  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0168  hypothetical protein  28.47 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  30.51 
 
 		 436 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  30.43 
 
 		 410 aa  157  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1597  hypothetical protein  27.97 
 
 		 412 aa  156  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0060  hypothetical protein  29.16 
 
 		 437 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  29.53 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  22.58 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0694  hypothetical protein  27.82 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.452898  normal  0.129497 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1319  hypothetical protein  27.84 
 
 		 445 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150757 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1338  hypothetical protein  27.84 
 
 		 445 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1302  hypothetical protein  27.84 
 
 		 445 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  22.47 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  23.32 
 
 		 464 aa  67  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  25.85 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.92 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  23.32 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.6 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.04 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  23.13 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  22.77 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  23.88 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  23.51 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  25.18 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  28.19 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  22.76 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  23.06 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  23.79 
 
 		 589 aa  57.4  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  23.9 
 
 		 456 aa  57  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  36.59 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  41.56 
 
 		 455 aa  55.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  37.8 
 
 		 453 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  24.53 
 
 		 503 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.83 
 
 		 479 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  32.54 
 
 		 486 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  31.38 
 
 		 520 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  40.26 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  41.03 
 
 		 477 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  25.88 
 
 		 516 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  37.8 
 
 		 453 aa  53.9  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  38.96 
 
 		 453 aa  54.3  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  21 
 
 		 466 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  24.8 
 
 		 503 aa  53.5  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  42.86 
 
 		 624 aa  53.5  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  21.01 
 
 		 466 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  39.76 
 
 		 478 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  31.75 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  26.74 
 
 		 488 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0063  amine oxidase  38.96 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  27.53 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  28.42 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  21.52 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  18.08 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  39.29 
 
 		 722 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  27.23 
 
 		 488 aa  52.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  28.98 
 
 		 461 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  37.66 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  37.66 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  37.23 
 
 		 512 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  36.71 
 
 		 484 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  37.66 
 
 		 417 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  25.27 
 
 		 496 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  37.66 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3174  squalene-associated FAD-dependent desaturase  36.84 
 
 		 417 aa  51.2  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  37.66 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 528 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 		 643 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  37.66 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  23.69 
 
 		 484 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  22.63 
 
 		 472 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  20.59 
 
 		 465 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  37.66 
 
 		 599 aa  50.1  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  29.57 
 
 		 450 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  29.03 
 
 		 500 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  29.57 
 
 		 450 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  35.44 
 
 		 484 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  37.66 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  39.73 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  35.44 
 
 		 499 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  67.57 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  54.76 
 
 		 499 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0696  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.71 
 
 		 577 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>