131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0201 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  910  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  35.73 
 
 
454 aa  269  8e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  30.86 
 
 
439 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  31.2 
 
 
427 aa  169  8e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  28.04 
 
 
440 aa  159  7e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  28.72 
 
 
422 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  29.68 
 
 
410 aa  149  1e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  29.11 
 
 
421 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  30.55 
 
 
406 aa  140  4e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  29.15 
 
 
408 aa  139  9e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  29.01 
 
 
403 aa  137  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  28.57 
 
 
430 aa  135  1e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  28.15 
 
 
452 aa  132  1e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  8.89729e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  28.83 
 
 
423 aa  130  5e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  28.39 
 
 
422 aa  129  1e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  27.27 
 
 
410 aa  115  2e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  34.09 
 
 
203 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  36.76 
 
 
437 aa  105  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  27.95 
 
 
449 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  25.47 
 
 
482 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  26.19 
 
 
455 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  26.7 
 
 
464 aa  90.1  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  45.16 
 
 
445 aa  87.8  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  44.21 
 
 
478 aa  84  5e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  32.93 
 
 
464 aa  81.6  2e-14  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  36.64 
 
 
360 aa  80.9  4e-14  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  33.33 
 
 
769 aa  79.3  1e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  34.55 
 
 
415 aa  75.5  2e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  37.5 
 
 
577 aa  74.3  4e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  34.29 
 
 
420 aa  73.6  6e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  34.15 
 
 
418 aa  72.4  1e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  35.96 
 
 
414 aa  67.4  5e-10  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  33.93 
 
 
453 aa  64.3  4e-09  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  32.29 
 
 
709 aa  63.9  6e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  31.25 
 
 
445 aa  63.5  7e-09  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  31.3 
 
 
736 aa  62.8  1e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.46 
 
 
429 aa  57.4  5e-07  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  21.99 
 
 
452 aa  56.2  1e-06  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  25.76 
 
 
369 aa  56.2  1e-06  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  22.59 
 
 
695 aa  55.8  2e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  41.27 
 
 
416 aa  55.5  2e-06  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  34.78 
 
 
712 aa  53.1  1e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  41.18 
 
 
650 aa  52.4  2e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  42.22 
 
 
935 aa  52.4  2e-05  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  42 
 
 
864 aa  52  2e-05  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1783  hypothetical protein  32.18 
 
 
447 aa  51.6  3e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  28 
 
 
532 aa  50.8  4e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  36.99 
 
 
708 aa  51.2  4e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  39.02 
 
 
608 aa  50.1  7e-05  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  31.37 
 
 
352 aa  50.1  8e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  27.78 
 
 
976 aa  50.1  8e-05  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  23.12 
 
 
530 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0003  DNA replication and repair protein RecF  47.62 
 
 
370 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  21.94 
 
 
368 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  45 
 
 
339 aa  48.9  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  50 
 
 
401 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  32.18 
 
 
457 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  41.86 
 
 
362 aa  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  1.15018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  26.27 
 
 
712 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  38.1 
 
 
994 aa  47.8  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  44 
 
 
669 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  29.41 
 
 
353 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  41.18 
 
 
1021 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  31.11 
 
 
369 aa  47.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  43.18 
 
 
363 aa  47  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  41.18 
 
 
496 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2562  hypothetical protein  33.93 
 
 
541 aa  47  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.21 
 
 
642 aa  47.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  44.44 
 
 
812 aa  47  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  35.82 
 
 
680 aa  46.6  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  42.22 
 
 
553 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  42.22 
 
 
553 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  48.84 
 
 
368 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  42.22 
 
 
553 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  31.82 
 
 
450 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  40.35 
 
 
852 aa  46.2  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  29 
 
 
582 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  40.48 
 
 
993 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  42.22 
 
 
553 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.03072e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  42.22 
 
 
553 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  40.35 
 
 
852 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  29.09 
 
 
533 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  42.22 
 
 
553 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  41.3 
 
 
553 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.58292e-08  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  42.22 
 
 
553 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  42.22 
 
 
553 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  27.63 
 
 
176 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  40.48 
 
 
993 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  30.77 
 
 
610 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  36.17 
 
 
924 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  40.48 
 
 
993 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  41.3 
 
 
758 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  37.25 
 
 
442 aa  45.8  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  46.15 
 
 
415 aa  45.8  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  9.51254e-07  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  46.81 
 
 
623 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1507  SMC domain protein  33.73 
 
 
1115 aa  45.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.44218  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  36.17 
 
 
890 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  47.62 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.15476e-13 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  38.3 
 
 
895 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2782  hypothetical protein  25.68 
 
 
440 aa  45.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>