More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1942 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  76.19 
 
 		 240 aa  352  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  74.25 
 
 		 238 aa  350  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  73.16 
 
 		 243 aa  337  9e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  71.43 
 
 		 245 aa  337  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  67.93 
 
 		 248 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  66.4 
 
 		 253 aa  332  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  68.35 
 
 		 244 aa  332  3e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  67.09 
 
 		 238 aa  331  6e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  67.93 
 
 		 244 aa  331  8e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  68.1 
 
 		 244 aa  325  6e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  68.4 
 
 		 251 aa  318  5e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  64.49 
 
 		 253 aa  318  5e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  66.24 
 
 		 240 aa  317  7.999999999999999e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  67.24 
 
 		 235 aa  315  5e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  64.94 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  65.81 
 
 		 238 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  64.29 
 
 		 248 aa  309  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  61.75 
 
 		 245 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  64.14 
 
 		 241 aa  310  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  65.81 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  64.94 
 
 		 235 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  68.1 
 
 		 241 aa  305  7e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  67.1 
 
 		 236 aa  304  7e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  60.83 
 
 		 244 aa  304  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  60.91 
 
 		 245 aa  299  3e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  62.34 
 
 		 234 aa  298  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  65.52 
 
 		 240 aa  298  7e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  64.94 
 
 		 236 aa  295  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  62.77 
 
 		 235 aa  294  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  61.47 
 
 		 234 aa  291  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  61.47 
 
 		 234 aa  291  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  58.7 
 
 		 236 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  62.34 
 
 		 234 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  60 
 
 		 245 aa  282  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  62.55 
 
 		 250 aa  276  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  56.89 
 
 		 236 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  56 
 
 		 236 aa  260  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  52.16 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  52.91 
 
 		 233 aa  255  5e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  52.91 
 
 		 233 aa  255  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  51.54 
 
 		 234 aa  254  9e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  55.16 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  53.54 
 
 		 239 aa  253  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.86 
 
 		 233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  52.81 
 
 		 234 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  49.56 
 
 		 234 aa  249  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  51.12 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  50.22 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  49.57 
 
 		 236 aa  241  9e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  50.22 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  48.02 
 
 		 233 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  50.89 
 
 		 233 aa  238  8e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  48.9 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  50.86 
 
 		 235 aa  236  4e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  50 
 
 		 232 aa  234  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  51.13 
 
 		 233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  46.26 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.43 
 
 		 233 aa  228  5e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  48.46 
 
 		 232 aa  228  8e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.7 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  49.14 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  43.48 
 
 		 604 aa  215  4e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  50.45 
 
 		 243 aa  215  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  47.98 
 
 		 233 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  48.17 
 
 		 232 aa  209  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  46.36 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  49.09 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  44.54 
 
 		 230 aa  205  7e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  51.13 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  46.26 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  47.32 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  46.19 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  47.95 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  46.61 
 
 		 240 aa  202  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  47.95 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  45.18 
 
 		 255 aa  202  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  48.65 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 246 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  46.93 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  46.93 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4336  ABC transporter related  48.91 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2600  ABC transporter related  48.84 
 
 		 227 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  44.54 
 
 		 242 aa  198  6e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  41.88 
 
 		 300 aa  198  7.999999999999999e-50  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  45.7 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  45.06 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  46.36 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  47.35 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 		 234 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  50.24 
 
 		 234 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  43.8 
 
 		 268 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  49.53 
 
 		 277 aa  195  6e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  47.66 
 
 		 247 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>