More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2236 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  310  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  99.35 
 
 		 155 aa  309  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  90.26 
 
 		 155 aa  273  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 169 aa  144  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  42.65 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 174 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0436  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0742867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  36.69 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  32.35 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3794  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3167  transcriptional regulator, putative  28.15 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  28.99 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  35.14 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  34.06 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  30.25 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  27.14 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0059  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0308587  hitchhiker  0.00000975355 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4909  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5154  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07865e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5284  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>