136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1387 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  370  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  77.6 
 
 		 185 aa  280  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  75.54 
 
 		 186 aa  267  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  75.96 
 
 		 183 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  73.26 
 
 		 169 aa  247  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  70.27 
 
 		 182 aa  243  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  69.41 
 
 		 169 aa  227  6e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  58.82 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  62.22 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 160 aa  167  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  51.4 
 
 		 187 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  57.53 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  53.85 
 
 		 163 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  53.21 
 
 		 163 aa  157  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  59.71 
 
 		 191 aa  157  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  62.31 
 
 		 174 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  65 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 173 aa  155  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 172 aa  153  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  53.96 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 169 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  44.19 
 
 		 168 aa  111  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 170 aa  107  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 172 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  40.11 
 
 		 183 aa  99.4  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 175 aa  95.9  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 151 aa  93.2  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  34.75 
 
 		 151 aa  93.2  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 152 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 		 167 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  46.15 
 
 		 167 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  37.84 
 
 		 148 aa  89  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 158 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 148 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  37.8 
 
 		 156 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 160 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 147 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 160 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 160 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 325 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 321 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 159 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 144 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 326 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 326 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 326 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0413  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.019986  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 336 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 326 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 326 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.99 
 
 		 312 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 329 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  26.21 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 146 aa  45.1  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 162 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  27.27 
 
 		 146 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 144 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 144 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 144 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  27.27 
 
 		 146 aa  44.7  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  27.27 
 
 		 146 aa  44.7  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  27.27 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  35.14 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 323 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>