More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2445 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.01 
 
 
1141 aa  985  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  37.53 
 
 
1161 aa  720  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  34.91 
 
 
1196 aa  680  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  70.69 
 
 
1149 aa  1661  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.55 
 
 
1937 aa  683  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  70.05 
 
 
1155 aa  1633  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 
2037 aa  640  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  38.53 
 
 
1158 aa  764  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.32 
 
 
1038 aa  920  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.24 
 
 
1936 aa  676  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.78 
 
 
1680 aa  720  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
1203 aa  735  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.4 
 
 
1713 aa  723  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.83 
 
 
1356 aa  769  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  47.37 
 
 
1177 aa  953  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.58 
 
 
1194 aa  1127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.82 
 
 
1155 aa  815  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 
1142 aa  691  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  37.85 
 
 
1200 aa  738  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  41.55 
 
 
1937 aa  682  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  70.76 
 
 
1155 aa  1664  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.87 
 
 
1143 aa  969  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  40.84 
 
 
1695 aa  674  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 
1189 aa  697  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  43.26 
 
 
1374 aa  781  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  63.5 
 
 
1168 aa  1466  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 
2099 aa  677  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.22 
 
 
1137 aa  934  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  60.29 
 
 
1158 aa  1362  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.63 
 
 
1159 aa  1004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  42.48 
 
 
1278 aa  756  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 
1954 aa  730  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.9 
 
 
1839 aa  682  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.08 
 
 
1145 aa  979  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  45.86 
 
 
1137 aa  936  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.92 
 
 
2099 aa  696  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.84 
 
 
1216 aa  728  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.53 
 
 
1037 aa  793  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  76.02 
 
 
1163 aa  1842  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.37 
 
 
1195 aa  765  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.81 
 
 
1917 aa  766  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  93.09 
 
 
1170 aa  2221  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  70.67 
 
 
1155 aa  1663  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  100 
 
 
1172 aa  2378  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.36 
 
 
1896 aa  707  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.9 
 
 
1165 aa  1125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.04 
 
 
1195 aa  1120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.89 
 
 
1937 aa  673  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  59.43 
 
 
1158 aa  1387  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 
1201 aa  702  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.61 
 
 
2107 aa  686  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 
1964 aa  635  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 
1162 aa  634  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 
1131 aa  629  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.89 
 
 
1161 aa  628  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.23 
 
 
1942 aa  615  1e-174  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 
1792 aa  562  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 
2010 aa  532  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 
1160 aa  504  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
1361 aa  505  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 
1816 aa  439  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.44 
 
 
1782 aa  432  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 
1237 aa  422  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
1303 aa  400  1e-110  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  32.3 
 
 
896 aa  399  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  31.83 
 
 
896 aa  396  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 
1214 aa  395  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  31.48 
 
 
896 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  31.72 
 
 
896 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  31.72 
 
 
896 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 
1119 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  31.55 
 
 
896 aa  393  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  31.39 
 
 
896 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  31.49 
 
 
896 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
896 aa  388  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 
1406 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 
922 aa  389  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  31.64 
 
 
896 aa  386  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 
920 aa  377  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  36.36 
 
 
1392 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 
1159 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4523  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 
1179 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522992  decreased coverage  0.00180703 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 
916 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3328  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 
1482 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 
1853 aa  365  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.61 
 
 
1857 aa  359  1e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 
1843 aa  357  6e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 
1847 aa  357  8e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 
1271 aa  355  3e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.09 
 
 
1588 aa  355  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1053  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
1458 aa  353  7e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4103  ATPase domain-containing protein  35.75 
 
 
1179 aa  347  5e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.972573  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4049  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 
1406 aa  346  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.66 
 
 
1468 aa  345  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5202  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 
1478 aa  345  3e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29 
 
 
1362 aa  344  5e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 
1400 aa  343  8e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  28.86 
 
 
1361 aa  340  1e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 
1479 aa  332  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.26 
 
 
1172 aa  322  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0698206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>