More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0499 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  66.29 
 
 		 539 aa  701    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  100 
 
 		 534 aa  1070    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  62.55 
 
 		 549 aa  640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  60.82 
 
 		 539 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  58.67 
 
 		 553 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  56.85 
 
 		 541 aa  593  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  60.46 
 
 		 531 aa  593  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  56.46 
 
 		 536 aa  553  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  51.24 
 
 		 518 aa  448  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  46.42 
 
 		 562 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  48.5 
 
 		 522 aa  435  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  44.88 
 
 		 555 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  45.64 
 
 		 539 aa  385  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  43.73 
 
 		 585 aa  365  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  45.05 
 
 		 510 aa  342  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  37.08 
 
 		 564 aa  289  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  37.84 
 
 		 592 aa  278  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  38.11 
 
 		 571 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  47.28 
 
 		 293 aa  220  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  34.19 
 
 		 506 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  46.39 
 
 		 290 aa  214  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  41.75 
 
 		 288 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  53.43 
 
 		 203 aa  206  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  43.42 
 
 		 285 aa  204  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  50.74 
 
 		 204 aa  200  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  43.69 
 
 		 288 aa  199  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  44.9 
 
 		 312 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  48.68 
 
 		 311 aa  199  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  49.43 
 
 		 312 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  33.07 
 
 		 499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  52 
 
 		 203 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  29.69 
 
 		 549 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  45.89 
 
 		 285 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  42.76 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  54.64 
 
 		 204 aa  190  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  43.94 
 
 		 286 aa  188  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  42.96 
 
 		 292 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  42.96 
 
 		 292 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  42.96 
 
 		 292 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  48.76 
 
 		 201 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  42.32 
 
 		 288 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  42.23 
 
 		 298 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  39.94 
 
 		 298 aa  181  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  46.53 
 
 		 205 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  41.03 
 
 		 282 aa  177  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  38.75 
 
 		 325 aa  177  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  41.69 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  39.18 
 
 		 300 aa  176  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  44.37 
 
 		 282 aa  173  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  45.5 
 
 		 203 aa  173  6.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  42.06 
 
 		 248 aa  169  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  45.5 
 
 		 200 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  45.93 
 
 		 235 aa  163  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  36.92 
 
 		 350 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  47.21 
 
 		 233 aa  161  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  46.27 
 
 		 212 aa  161  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  37.03 
 
 		 350 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  33.33 
 
 		 334 aa  159  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  35.87 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  39.93 
 
 		 309 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  35.31 
 
 		 343 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  38.56 
 
 		 332 aa  154  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  45.45 
 
 		 209 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  45.79 
 
 		 203 aa  154  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  36.88 
 
 		 339 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  36.91 
 
 		 339 aa  153  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  36.81 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  44.72 
 
 		 221 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  44.72 
 
 		 221 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  44.72 
 
 		 221 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  36.74 
 
 		 355 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  33.44 
 
 		 365 aa  146  9e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  36.45 
 
 		 353 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  34.85 
 
 		 348 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  34.85 
 
 		 349 aa  145  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  41.71 
 
 		 218 aa  143  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5123  hypothetical protein  35.47 
 
 		 309 aa  143  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  37.18 
 
 		 309 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  35.25 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  35.69 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  35.69 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  35.69 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  35.58 
 
 		 359 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  35.58 
 
 		 371 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  35.99 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  35.58 
 
 		 359 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  35.58 
 
 		 359 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  35.58 
 
 		 371 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  35.58 
 
 		 371 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  32.77 
 
 		 319 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  35.58 
 
 		 371 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0097  allophanate hydrolase subunit 1  40.44 
 
 		 258 aa  141  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  34.3 
 
 		 345 aa  141  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  35.99 
 
 		 356 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1378  Allophanate hydrolase subunit 1  44.32 
 
 		 222 aa  141  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  41.98 
 
 		 217 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  34.58 
 
 		 312 aa  141  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  36.88 
 
 		 355 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1268  Allophanate hydrolase subunit 1  40.27 
 
 		 219 aa  140  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  42.52 
 
 		 229 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>