198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0097 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0097  allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 		 258 aa  498  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0094  allophanate hydrolase subunit 1  66.67 
 
 		 247 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  48.89 
 
 		 203 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  44.12 
 
 		 248 aa  155  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  44.89 
 
 		 203 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  40.89 
 
 		 534 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  41.7 
 
 		 553 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  41.7 
 
 		 539 aa  142  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  39.46 
 
 		 549 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  38.67 
 
 		 539 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  39.46 
 
 		 204 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  42.73 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  39.38 
 
 		 522 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  40.45 
 
 		 536 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  39.11 
 
 		 531 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0593  allophanate hydrolase subunit 1  43.48 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0362915  normal  0.623241 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  38.29 
 
 		 541 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  43.05 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  40.36 
 
 		 518 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  41.82 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  40.45 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  43.5 
 
 		 200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  43.58 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  43.58 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  43.58 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  39.46 
 
 		 203 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  40.44 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1801  hypothetical protein  54.24 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  41.41 
 
 		 564 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  40.34 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  56.03 
 
 		 510 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  38.67 
 
 		 205 aa  122  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1268  Allophanate hydrolase subunit 1  42.13 
 
 		 219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  38.91 
 
 		 218 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  51.59 
 
 		 217 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  52 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1378  Allophanate hydrolase subunit 1  54.31 
 
 		 222 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  40.27 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  40.69 
 
 		 216 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  40.77 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  40.61 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  42.08 
 
 		 539 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  51.61 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  46.83 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  50.41 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  49.59 
 
 		 201 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  50 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  38.08 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  40.38 
 
 		 571 aa  112  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0023  hypothetical protein  48.36 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  50 
 
 		 215 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  50 
 
 		 217 aa  111  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282421 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  48.8 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  48.8 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  48.41 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  48.8 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  48.8 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0025  allophanate hydrolase, subunit 1  45.6 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  48.8 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  48.8 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  48.8 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  37.66 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  34.96 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  47.62 
 
 		 218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  46.03 
 
 		 218 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  50 
 
 		 215 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  49.21 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  49.21 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  49.21 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  49.21 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  50.41 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  49.21 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  48.41 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  49.21 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  49.21 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  36.48 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  49.21 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  47.2 
 
 		 218 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  38.89 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  47.24 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  47.24 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  47.24 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  47.24 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0010  allophanate hydrolase subunit 1  47.2 
 
 		 226 aa  105  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  36.48 
 
 		 218 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  36.48 
 
 		 218 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  46.46 
 
 		 218 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  43.44 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  35.27 
 
 		 555 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  36.49 
 
 		 562 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  38.76 
 
 		 592 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  50.81 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  36.52 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  43.09 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0012  hypothetical protein  43.31 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2813  hypothetical protein  50.43 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.893374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  48.8 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  47.58 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  46.62 
 
 		 499 aa  102  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1313  allophanate hydrolase subunit 1  40.44 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.837273  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>