More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0102 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0102  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 537 aa  1087    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.102568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2422  MscS mechanosensitive ion channel  58.81 
 
 		 572 aa  606  9.999999999999999e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0293  MscS mechanosensitive ion channel  42.86 
 
 		 447 aa  320  5e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3659  MscS mechanosensitive ion channel  41.82 
 
 		 439 aa  295  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  34.62 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5986  MscS Mechanosensitive ion channel  39.27 
 
 		 337 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0743  MscS Mechanosensitive ion channel  29.32 
 
 		 460 aa  170  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2989  Ricin B lectin  28.61 
 
 		 474 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129425 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  33.11 
 
 		 311 aa  160  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1940  MscS mechanosensitive ion channel  31.45 
 
 		 489 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  28.35 
 
 		 459 aa  147  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02489  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  31.58 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  34.98 
 
 		 349 aa  140  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4142  MscS mechanosensitive ion channel  30.5 
 
 		 384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.93898  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  33.2 
 
 		 307 aa  130  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1496  MscS Mechanosensitive ion channel  29.69 
 
 		 295 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  25.91 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  31.54 
 
 		 328 aa  126  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  29.3 
 
 		 330 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4521  MscS Mechanosensitive ion channel  27.34 
 
 		 291 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  27.82 
 
 		 331 aa  110  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 		 274 aa  108  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  29.86 
 
 		 400 aa  108  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  34.01 
 
 		 429 aa  108  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  27.6 
 
 		 336 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  26.28 
 
 		 316 aa  107  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  28.46 
 
 		 283 aa  107  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  29.39 
 
 		 279 aa  107  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  26.12 
 
 		 276 aa  107  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  32.49 
 
 		 272 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  28.98 
 
 		 298 aa  103  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  26.53 
 
 		 276 aa  103  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  31.85 
 
 		 283 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  27.24 
 
 		 544 aa  101  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  30.45 
 
 		 393 aa  101  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 270 aa  100  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  25.27 
 
 		 296 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  27.88 
 
 		 288 aa  100  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  27.94 
 
 		 531 aa  99.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  29.09 
 
 		 356 aa  99.4  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  28.79 
 
 		 534 aa  99  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 		 262 aa  99.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2128  MscS mechanosensitive ion channel  27.71 
 
 		 270 aa  98.6  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  27.97 
 
 		 291 aa  97.8  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  27.46 
 
 		 389 aa  98.2  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 		 295 aa  97.8  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1853  MscS mechanosensitive ion channel  25.76 
 
 		 290 aa  97.8  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0108  MscS mechanosensitive ion channel  28.18 
 
 		 304 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 322 aa  96.3  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  26.13 
 
 		 270 aa  95.9  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  29.68 
 
 		 324 aa  94.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  29.34 
 
 		 305 aa  94.4  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  28.91 
 
 		 360 aa  94  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  27.09 
 
 		 406 aa  94  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  28.01 
 
 		 304 aa  94  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 298 aa  93.6  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  25.78 
 
 		 297 aa  93.2  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  32.4 
 
 		 421 aa  93.2  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  25.94 
 
 		 258 aa  92.8  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  30.25 
 
 		 280 aa  92.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  28.17 
 
 		 300 aa  92  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  29.35 
 
 		 538 aa  92.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  28.46 
 
 		 561 aa  92  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  27.12 
 
 		 414 aa  91.7  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  26.52 
 
 		 532 aa  91.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  31.44 
 
 		 385 aa  91.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  25.11 
 
 		 310 aa  91.3  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 297 aa  91.3  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  31.18 
 
 		 401 aa  90.9  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  28.83 
 
 		 268 aa  90.9  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  28.79 
 
 		 547 aa  90.9  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  31.31 
 
 		 292 aa  90.5  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  26.5 
 
 		 276 aa  90.5  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  28.8 
 
 		 273 aa  90.1  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 540 aa  90.5  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  25.97 
 
 		 547 aa  90.1  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  27.96 
 
 		 360 aa  90.1  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  26.35 
 
 		 280 aa  89.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  26.07 
 
 		 460 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  27.45 
 
 		 301 aa  90.1  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  28.44 
 
 		 359 aa  89.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2402  hypothetical protein  29.88 
 
 		 279 aa  89.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.267781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  31.18 
 
 		 401 aa  89.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 267 aa  90.1  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  28.69 
 
 		 287 aa  89.7  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  28.78 
 
 		 310 aa  89.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  27.96 
 
 		 280 aa  89.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 		 275 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  26.94 
 
 		 288 aa  89  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  26.42 
 
 		 551 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 408 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  25.64 
 
 		 460 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  26.42 
 
 		 551 aa  89  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  27.05 
 
 		 267 aa  88.6  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 637 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  29.78 
 
 		 269 aa  88.6  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  29.81 
 
 		 272 aa  88.2  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  27.6 
 
 		 293 aa  88.6  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  26.44 
 
 		 550 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>