More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0355 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_16651  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.56 
 
 		 1097 aa  897    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16891  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.02 
 
 		 1097 aa  905    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0589  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.95 
 
 		 1252 aa  666    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0603  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.23 
 
 		 1272 aa  788    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2863  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.31 
 
 		 1370 aa  682    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0447  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  39.34 
 
 		 1357 aa  673    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  unclonable  0.00000104807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1265  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  57.17 
 
 		 1229 aa  710    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2421  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  44.9 
 
 		 1167 aa  980    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.142717  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0183  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.49 
 
 		 1183 aa  1021    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0702536  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1066  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.31 
 
 		 1358 aa  706    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369234  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0024  DNA-directed RNA polymerase subunit beta/beta'  38.91 
 
 		 2837 aa  640    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3034  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  39.98 
 
 		 1368 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0207324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  55.25 
 
 		 1177 aa  921    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.907147  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4769  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.47 
 
 		 1342 aa  663    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0160  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.54 
 
 		 1191 aa  879    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1243  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.39 
 
 		 1377 aa  712    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.510388  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1914  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.46 
 
 		 1368 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0417426  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0619  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  39.86 
 
 		 1357 aa  667    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.739155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  55.37 
 
 		 1177 aa  922    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0098  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  55.25 
 
 		 1177 aa  921    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl598  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  43.19 
 
 		 1284 aa  857    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0096  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  55.25 
 
 		 1177 aa  921    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5081  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.84 
 
 		 1372 aa  701    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563894  normal  0.835448 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3816  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.46 
 
 		 1368 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4555  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  39.86 
 
 		 1357 aa  668    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00695009 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2654  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.22 
 
 		 1155 aa  905    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.679256  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1016  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.45 
 
 		 1095 aa  902    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0988562  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3189  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  38.35 
 
 		 1368 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.544144  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0398  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  39.6 
 
 		 1359 aa  666    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0653652  normal  0.0371296 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1350  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.38 
 
 		 1380 aa  709    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0511813  normal  0.845887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4207  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.27 
 
 		 1117 aa  909    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3786  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.46 
 
 		 1368 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2331  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  41.88 
 
 		 1359 aa  683    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5086  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  39.86 
 
 		 1357 aa  672    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0807983  normal  0.53434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1061  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.04 
 
 		 1370 aa  692    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.449101  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0694  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40 
 
 		 1368 aa  682    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.46808  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3439  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  39.98 
 
 		 1368 aa  658    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1962  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.87 
 
 		 1301 aa  661    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.768715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0605  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.11 
 
 		 1097 aa  888    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0357  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.78 
 
 		 1300 aa  672    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2067  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.45 
 
 		 1097 aa  890    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.883429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0578  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41 
 
 		 1240 aa  781    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219767  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2997  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  38.75 
 
 		 1375 aa  655    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0288  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  39.04 
 
 		 1352 aa  651    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  55.37 
 
 		 1177 aa  922    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1578  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.56 
 
 		 1097 aa  902    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.702205  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1522  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.33 
 
 		 1100 aa  909    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.18343 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0070  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  44.44 
 
 		 1287 aa  883    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0207  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.9 
 
 		 1145 aa  1024    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000841151  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2468  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.94 
 
 		 1141 aa  978    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716537 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3076  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.36 
 
 		 1368 aa  658    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3469  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.46 
 
 		 1368 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.565589  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0573  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.95 
 
 		 1141 aa  901    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0565  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.99 
 
 		 1183 aa  1016    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0997  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.8 
 
 		 1172 aa  880    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0462  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  60.49 
 
 		 1263 aa  1106    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1016  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.67 
 
 		 1122 aa  893    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0924  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.55 
 
 		 1361 aa  674    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.235944  hitchhiker  0.0000468436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0480  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  39.34 
 
 		 1357 aa  673    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262679  normal  0.0306779 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0272  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  39.76 
 
 		 1390 aa  667    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0306  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.18 
 
 		 1368 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3754  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.46 
 
 		 1368 aa  660    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.131215  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3195  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.43 
 
 		 1374 aa  705    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1531  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.48 
 
 		 1380 aa  713    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0502  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  40.43 
 
 		 1340 aa  676    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.60191  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1492  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  44.38 
 
 		 1202 aa  981    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0636  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.82 
 
 		 1152 aa  822    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5097  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.44 
 
 		 1174 aa  878    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0605321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3916  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  39.71 
 
 		 1357 aa  675    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2767  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  39.98 
 
 		 1368 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0969  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  44.22 
 
 		 1166 aa  940    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2162  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  50.95 
 
 		 1141 aa  893    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.906254  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0046  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  39.22 
 
 		 1366 aa  654    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.148262  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3169  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.5 
 
 		 1291 aa  694    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2722  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.5 
 
 		 1234 aa  1045    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.304828  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2408  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.42 
 
 		 1234 aa  1043    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154863  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2939  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50 
 
 		 1102 aa  888    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04361  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.32 
 
 		 1097 aa  885    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18861  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.56 
 
 		 1095 aa  905    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.816976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0451  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.14 
 
 		 1355 aa  687    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1205  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.49 
 
 		 1377 aa  710    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.130962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2341  DNA-directed RNA polymerase  51.29 
 
 		 1107 aa  926    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1943  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  39.37 
 
 		 1270 aa  636    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205302  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0259  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.18 
 
 		 1368 aa  658    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.84046  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1981  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.78 
 
 		 1196 aa  885    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1375  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit  44.04 
 
 		 1197 aa  972    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0284  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  44.57 
 
 		 1212 aa  968    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140323 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1825  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  43.79 
 
 		 1202 aa  967    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1845  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  43.67 
 
 		 1193 aa  984    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2984  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  44.5 
 
 		 1171 aa  929    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.816436  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0340  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  39.98 
 
 		 1368 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1549  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  40.14 
 
 		 1370 aa  699    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2724  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.28 
 
 		 1250 aa  1041    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.280863  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0299  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.66 
 
 		 1169 aa  904    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.289387 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0233  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.28 
 
 		 1312 aa  666    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3933  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.83 
 
 		 1143 aa  894    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.854688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0711  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.57 
 
 		 1166 aa  884    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0987  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  44.22 
 
 		 1172 aa  940    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1257  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.69 
 
 		 1161 aa  880    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.568598 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16761  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.35 
 
 		 1097 aa  911    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>