More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0462 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1782  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  71.5 
 
 
1182 aa  1185    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3687  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  47.42 
 
 
1278 aa  891    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0603  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.63 
 
 
1272 aa  809    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0355  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  60.49 
 
 
1187 aa  1107    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0565  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.79 
 
 
1183 aa  888    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2421  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.03 
 
 
1167 aa  813    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.142717  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0183  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.8 
 
 
1183 aa  892    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0702536  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1066  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.33 
 
 
1358 aa  689    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369234  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0997  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.88 
 
 
1172 aa  874    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249941  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.59 
 
 
1177 aa  914    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.907147  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0160  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.96 
 
 
1191 aa  876    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1243  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.34 
 
 
1377 aa  683    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.510388  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10681  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.65 
 
 
1178 aa  870    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1947  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.44 
 
 
1377 aa  683    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.59 
 
 
1177 aa  913    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0098  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.59 
 
 
1177 aa  914    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl598  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.56 
 
 
1284 aa  810    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0096  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.59 
 
 
1177 aa  914    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6057  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.95 
 
 
1141 aa  888    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0097  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.48 
 
 
1177 aa  913    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0207  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.17 
 
 
1145 aa  948    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000841151  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0741  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.37 
 
 
1096 aa  850    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0114  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.59 
 
 
1130 aa  913    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.65239e-57 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2654  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.76 
 
 
1155 aa  894    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.679256  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1016  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.01 
 
 
1095 aa  850    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0988562  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16761  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.05 
 
 
1097 aa  861    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2724  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.1 
 
 
1250 aa  953    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.280863  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2679  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40 
 
 
1303 aa  650    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.20242  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4207  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.43 
 
 
1117 aa  850    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0502  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  64.75 
 
 
1172 aa  1199    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145308  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0680  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.49 
 
 
1171 aa  876    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0216  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.09 
 
 
1183 aa  1026    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.846031  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3364  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.67 
 
 
1358 aa  675    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209145 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18861  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.13 
 
 
1095 aa  853    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.816976  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0605  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.92 
 
 
1097 aa  845    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0357  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.2 
 
 
1300 aa  654    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2067  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.42 
 
 
1097 aa  840    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.883429  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1598  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.75 
 
 
1245 aa  769    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0310456  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0978  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.59 
 
 
1380 aa  672    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344498  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0391  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.55 
 
 
1155 aa  825    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.59 
 
 
1177 aa  913    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1578  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.8 
 
 
1097 aa  862    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.702205  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1522  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.79 
 
 
1100 aa  853    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.18343 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0070  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.6 
 
 
1287 aa  828    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16071  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.05 
 
 
1096 aa  853    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.614693  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2468  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  61.07 
 
 
1141 aa  942    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716537 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0477  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  98.5 
 
 
1263 aa  2531    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2106  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.67 
 
 
1384 aa  683    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0644464  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0573  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.77 
 
 
1141 aa  888    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf212  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.71 
 
 
1197 aa  710    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0024  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  39.78 
 
 
1392 aa  654    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0123  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.48 
 
 
1177 aa  913    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00273838  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2036  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  39.01 
 
 
1372 aa  638    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.947917 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0974  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  53.41 
 
 
1070 aa  860    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000799261  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0288  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.04 
 
 
1301 aa  664    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.120882  normal  0.0261022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0414  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.49 
 
 
1115 aa  927    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0178041  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0186  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  51 
 
 
1174 aa  938    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0749  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40 
 
 
1384 aa  677    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.910245  normal  0.541943 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0462  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  100 
 
 
1263 aa  2558    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0133  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.59 
 
 
1177 aa  914    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000446144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5203  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.48 
 
 
1177 aa  913    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000890566  unclonable  1.148e-23 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0578  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.83 
 
 
1240 aa  818    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219767  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1492  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.29 
 
 
1202 aa  870    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4676  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  37.19 
 
 
1489 aa  641    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.765247  hitchhiker  0.00735061 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0636  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.82 
 
 
1152 aa  818    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0579  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.89 
 
 
1183 aa  893    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0965  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.4 
 
 
1187 aa  842    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5097  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.36 
 
 
1174 aa  867    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0605321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0969  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.88 
 
 
1166 aa  874    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2162  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  56.85 
 
 
1141 aa  878    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.906254  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0319  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.77 
 
 
1302 aa  665    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.672728  hitchhiker  0.00209442 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2722  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.96 
 
 
1234 aa  962    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.304828  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2408  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.96 
 
 
1234 aa  962    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154863  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16651  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.92 
 
 
1097 aa  858    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2939  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.39 
 
 
1102 aa  830    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16891  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.92 
 
 
1097 aa  860    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04361  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.05 
 
 
1097 aa  854    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1016  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.29 
 
 
1122 aa  850    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2341  DNA-directed RNA polymerase  56.94 
 
 
1107 aa  907    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2196  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.57 
 
 
1384 aa  680    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.035759  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3933  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.37 
 
 
1143 aa  884    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.854688  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4325  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.65 
 
 
1143 aa  876    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.0767673 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1981  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.06 
 
 
1196 aa  882    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1375  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit  46.84 
 
 
1197 aa  857    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0284  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.07 
 
 
1212 aa  868    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000140323 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1825  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.25 
 
 
1202 aa  856    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1845  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.02 
 
 
1193 aa  878    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2984  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  55.17 
 
 
1171 aa  867    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.816436  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1751  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.96 
 
 
1103 aa  851    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0244  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.77 
 
 
1217 aa  680    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0865  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.39 
 
 
1381 aa  660    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0299  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.31 
 
 
1169 aa  893    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.289387 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0859  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.96 
 
 
1238 aa  991    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111826  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0233  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.28 
 
 
1312 aa  658    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1339  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.53 
 
 
1497 aa  700    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0711  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.53 
 
 
1166 aa  872    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0987  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.88 
 
 
1172 aa  874    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1257  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.88 
 
 
1161 aa  874    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.568598 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1205  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.34 
 
 
1377 aa  682    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.130962  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1265  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.09 
 
 
1229 aa  750    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>