More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3567 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 295 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  33.44 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  30.07 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  28.97 
 
 		 303 aa  119  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  28.96 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  27.55 
 
 		 317 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  27.55 
 
 		 313 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  24.74 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  26.52 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  27.46 
 
 		 324 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  28.1 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  26.87 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  25.77 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  27.53 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  25.56 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  25.75 
 
 		 290 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  25.89 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  24.91 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  24.83 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  32.86 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  24.91 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  24.15 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  26.06 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  24.36 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  24.41 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  24.41 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  24.66 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  24.26 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  24.41 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  24.41 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  30.94 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  23.81 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  23.64 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  26.46 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  31.21 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  22.07 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  35.56 
 
 		 510 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  27.06 
 
 		 243 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  30.43 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000866037  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  43.04 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  43.37 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  41.56 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 638 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  37.11 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  43.04 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  43.04 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  43.04 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  44.71 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  28.65 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  41.77 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  47.22 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  39.47 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  28.99 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  23.23 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  28.78 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708227  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  50.75 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3582  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.645571  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  46.48 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  38.78 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  38.67 
 
 		 890 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  32.65 
 
 		 505 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  27.33 
 
 		 525 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  29.91 
 
 		 631 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2703  OmpA domain-containing protein  32.64 
 
 		 560 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.74535  normal  0.0183644 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1355  OmpA domain-containing protein  32.64 
 
 		 560 aa  65.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  30.22 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1467  OmpA/MotB domain-containing protein  32.64 
 
 		 560 aa  65.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.459953  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  32.98 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  31.25 
 
 		 420 aa  65.9  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  37.37 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3372  OmpA/MotB domain protein  37.21 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363185  hitchhiker  0.00000000701335 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  36.08 
 
 		 207 aa  65.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  41.25 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  32.71 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  30.58 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  37.23 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  40.51 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.51 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  42.25 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  30.89 
 
 		 641 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  36.59 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  41.89 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  33.88 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  26.25 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  36.11 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  43.48 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  40 
 
 		 607 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1687  OmpA/MotB domain protein  32.08 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  37.62 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  41.43 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  35.71 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.71 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  26.28 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0587  OmpA family outer membrane protein  35.63 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  33.05 
 
 		 656 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  35.71 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>