232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1877 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1877  porin  100 
 
 
361 aa  728    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000050808  unclonable  0.0000817359 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1642  porin  73.26 
 
 
365 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000869717  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1671  porin  58.01 
 
 
363 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000474529  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1463  porin  42.19 
 
 
376 aa  281  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000881778  normal  0.0418658 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  28.47 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  29.6 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  30.52 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  28.52 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0590  porin  31.72 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124003  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  31.52 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3227  outer membrane porin, putative  33.33 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101033  hitchhiker  0.000000540368 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0822  porin  33.33 
 
 
354 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0441851  normal  0.422579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0545  outer membrane porin, putative  32.8 
 
 
355 aa  62.8  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00179021  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0815  porin Gram-negative type  32.82 
 
 
354 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00496289  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  28.46 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  26.64 
 
 
315 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0762  outer membrane porin, putative  32.82 
 
 
354 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000457647  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0790  porin  32.82 
 
 
354 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000041631  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3252  porin  30.65 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000145814  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2681  porin  24.81 
 
 
347 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201946  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3569  porin  32.47 
 
 
354 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136982  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  26.7 
 
 
386 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0734  porin  32.31 
 
 
354 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000494692  decreased coverage  0.0000362774 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2749  porin  24.81 
 
 
372 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  26.46 
 
 
316 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  23.45 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  31.4 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4499  outer membrane protein (porin)  27.9 
 
 
363 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4152  porin  26.56 
 
 
342 aa  57  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0544389  normal  0.155829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4008  porin  31.76 
 
 
354 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000296209  hitchhiker  0.0000000599213 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  27.37 
 
 
393 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0589  porin  29.89 
 
 
344 aa  56.2  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3228  porin  27.61 
 
 
356 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000270281  hitchhiker  0.000000479229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1722  outer membrane protein (porin)  25.91 
 
 
357 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0914033  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4151  porin  28.93 
 
 
348 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  27.49 
 
 
385 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  27.04 
 
 
411 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  26.73 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  27.49 
 
 
385 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1973  porin  26.03 
 
 
349 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  26.73 
 
 
383 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  27.72 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  27.48 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  25.41 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3613  porin  25.53 
 
 
310 aa  55.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.479442  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  27.49 
 
 
385 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4999  outer membrane protein (porin)  25.21 
 
 
363 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362759  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4009  porin  29.84 
 
 
342 aa  54.3  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000245606  unclonable  0.000000000165223 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  28.08 
 
 
314 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2403  outer membrane porin, putative  24.73 
 
 
351 aa  54.7  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.987816  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  23.84 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  28.08 
 
 
314 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  28.08 
 
 
314 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  25.24 
 
 
394 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  26.98 
 
 
314 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  28.36 
 
 
314 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  28.36 
 
 
314 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  25.3 
 
 
314 aa  53.5  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  28.36 
 
 
313 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  28.36 
 
 
314 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  26.94 
 
 
385 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  26.9 
 
 
430 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  26.9 
 
 
430 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  27.94 
 
 
388 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5135  outer membrane protein (porin)  27.04 
 
 
363 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.007051  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5724  outer membrane protein (porin)  27.04 
 
 
363 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  26.9 
 
 
384 aa  52.8  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  26.9 
 
 
384 aa  52.8  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  26.72 
 
 
385 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  26.9 
 
 
384 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  26.9 
 
 
384 aa  52.8  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  25.56 
 
 
393 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  26.9 
 
 
411 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0781  porin  27.13 
 
 
353 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000021464  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0544  outer membrane porin, putative  27.2 
 
 
361 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000269892  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  30.22 
 
 
376 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  28.21 
 
 
360 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2278  porin  25.87 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134296  normal  0.609479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  27.5 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0587  putative outer membrane porin  26.23 
 
 
365 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0881  putative outer membrane porin  26.23 
 
 
365 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2322  outer membrane porin protein  26.23 
 
 
365 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  23.08 
 
 
385 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1848  putative outer membrane porin  26.23 
 
 
365 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0156948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  23.57 
 
 
386 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  25.73 
 
 
523 aa  50.4  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  27.56 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  26.32 
 
 
382 aa  50.4  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  27.27 
 
 
321 aa  50.4  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  26.42 
 
 
383 aa  50.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5757  outer membrane porin  28.68 
 
 
387 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  26.17 
 
 
344 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  25.64 
 
 
363 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3140  outer membrane protein (porin)  27.04 
 
 
363 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.448151  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2587  porin  30.89 
 
 
351 aa  49.7  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  25.64 
 
 
362 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  25.64 
 
 
362 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  25.64 
 
 
362 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  25.64 
 
 
362 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  23.21 
 
 
386 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>