More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1693 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 928 aa  1862    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  80.41 
 
 		 928 aa  1530    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  80.41 
 
 		 937 aa  1527    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.01 
 
 		 970 aa  900    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  78.26 
 
 		 927 aa  1531    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  39.35 
 
 		 943 aa  633  1e-180  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  39.64 
 
 		 939 aa  632  1e-180  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.03 
 
 		 944 aa  633  1e-180  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.71 
 
 		 932 aa  624  1e-177  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  38.45 
 
 		 946 aa  617  1e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  37.49 
 
 		 955 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.85 
 
 		 972 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  38.75 
 
 		 954 aa  603  1.0000000000000001e-171  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.09 
 
 		 916 aa  569  1e-160  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.7 
 
 		 890 aa  558  1e-157  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  36.41 
 
 		 898 aa  554  1e-156  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.92 
 
 		 915 aa  555  1e-156  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.38 
 
 		 909 aa  549  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.58 
 
 		 926 aa  541  9.999999999999999e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.62 
 
 		 912 aa  536  1e-151  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.11 
 
 		 916 aa  538  1e-151  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.64 
 
 		 903 aa  529  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  36.06 
 
 		 903 aa  532  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.42 
 
 		 897 aa  525  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.69 
 
 		 905 aa  457  1e-127  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.48 
 
 		 913 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.73 
 
 		 913 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.32 
 
 		 946 aa  435  1e-120  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  36.22 
 
 		 888 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  34.7 
 
 		 873 aa  383  1e-105  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  32.85 
 
 		 1688 aa  384  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  32.85 
 
 		 875 aa  380  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  31.66 
 
 		 870 aa  350  5e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.77 
 
 		 1476 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  31.37 
 
 		 1435 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.57 
 
 		 933 aa  335  2e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  31.4 
 
 		 872 aa  335  2e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  30.69 
 
 		 874 aa  330  7e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.45 
 
 		 931 aa  329  1.0000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  31.5 
 
 		 1573 aa  325  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  30.41 
 
 		 874 aa  324  5e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  32.97 
 
 		 1388 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  31.3 
 
 		 1480 aa  322  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  30.32 
 
 		 874 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.28 
 
 		 1534 aa  322  3e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  30.09 
 
 		 872 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  32.51 
 
 		 1544 aa  320  7e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  31.83 
 
 		 1584 aa  320  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.75 
 
 		 1429 aa  318  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  30.83 
 
 		 915 aa  316  9.999999999999999e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.76 
 
 		 1426 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  31.56 
 
 		 1506 aa  316  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  30.69 
 
 		 1434 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.16 
 
 		 1412 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  31.68 
 
 		 922 aa  312  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.88 
 
 		 900 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  31.14 
 
 		 1495 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.7 
 
 		 1497 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.72 
 
 		 1517 aa  310  6.999999999999999e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.68 
 
 		 1523 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  31.85 
 
 		 1535 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.29 
 
 		 1502 aa  307  7e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.18 
 
 		 1514 aa  306  9.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  30.84 
 
 		 1534 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  34.08 
 
 		 1448 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  31.52 
 
 		 1509 aa  305  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  33.53 
 
 		 1419 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  30.4 
 
 		 1567 aa  304  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.8 
 
 		 1451 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  29.94 
 
 		 914 aa  303  8.000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  33.8 
 
 		 1448 aa  303  9e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.01 
 
 		 1539 aa  302  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  32.81 
 
 		 1431 aa  301  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  30.69 
 
 		 1523 aa  300  7e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.69 
 
 		 1523 aa  300  7e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.62 
 
 		 1475 aa  299  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.09 
 
 		 1561 aa  298  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  32.76 
 
 		 1504 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.43 
 
 		 1516 aa  298  4e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  32.66 
 
 		 1493 aa  297  8e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  30.22 
 
 		 1549 aa  295  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1413  DEAD/H associated domain protein  33.1 
 
 		 1606 aa  295  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0176402  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  30.64 
 
 		 1531 aa  295  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.96 
 
 		 1510 aa  294  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  31.16 
 
 		 1523 aa  294  7e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.100241 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  29.99 
 
 		 1632 aa  292  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  30.77 
 
 		 1538 aa  291  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  30.88 
 
 		 1538 aa  291  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  30.88 
 
 		 1538 aa  291  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  29.91 
 
 		 1620 aa  291  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  30.88 
 
 		 1538 aa  291  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  30.88 
 
 		 1538 aa  290  7e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.76 
 
 		 1480 aa  290  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  36.62 
 
 		 1515 aa  290  8e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  30.88 
 
 		 1525 aa  289  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.45 
 
 		 1518 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.13 
 
 		 1508 aa  290  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  30.55 
 
 		 1538 aa  289  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.7 
 
 		 1626 aa  288  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  30.42 
 
 		 1538 aa  287  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>