More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04735 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  100 
 
 		 395 aa  814    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  45.95 
 
 		 373 aa  327  3e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  41.59 
 
 		 488 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  40.55 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.31 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  36.78 
 
 		 424 aa  206  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  32.51 
 
 		 418 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  32.51 
 
 		 418 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  32.48 
 
 		 415 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  33.94 
 
 		 342 aa  186  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  33.59 
 
 		 374 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  36.16 
 
 		 355 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  30.54 
 
 		 434 aa  175  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  35.71 
 
 		 365 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  30.82 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  29.85 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.2 
 
 		 431 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  34.29 
 
 		 438 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  35.14 
 
 		 362 aa  170  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  32.6 
 
 		 671 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  33.49 
 
 		 440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  33.49 
 
 		 440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.42 
 
 		 387 aa  166  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  29.69 
 
 		 423 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  31.2 
 
 		 652 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  32.11 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  29.43 
 
 		 423 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  33.42 
 
 		 657 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  31.58 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  28.13 
 
 		 489 aa  161  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  29.47 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  33.17 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  28.68 
 
 		 421 aa  159  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  31.79 
 
 		 371 aa  159  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  32.73 
 
 		 373 aa  159  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  31.13 
 
 		 340 aa  159  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  31.28 
 
 		 446 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  30.37 
 
 		 313 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  29.14 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  29.91 
 
 		 450 aa  156  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  32.23 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.24 
 
 		 362 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  31.43 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  29 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  31.02 
 
 		 385 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  30.52 
 
 		 415 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  32.91 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  27.34 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  31.47 
 
 		 468 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  27.76 
 
 		 361 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  31.55 
 
 		 366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.72 
 
 		 359 aa  146  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  30.79 
 
 		 349 aa  146  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  28.97 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  27.86 
 
 		 689 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  28.57 
 
 		 492 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  30.73 
 
 		 344 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  32.26 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  27.93 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  30.65 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.6 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  28.38 
 
 		 500 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 		 414 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.09 
 
 		 415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  30.15 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2652  DNA-cytosine methyltransferase  32.03 
 
 		 435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0989832  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  27.08 
 
 		 698 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  28.64 
 
 		 325 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  27.03 
 
 		 686 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  28.64 
 
 		 446 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.25 
 
 		 501 aa  139  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.06 
 
 		 404 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  30.57 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  30.89 
 
 		 349 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  29.7 
 
 		 381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  29.31 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  28.78 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  29.74 
 
 		 310 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  28.64 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  29.49 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.65 
 
 		 405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  29.01 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  27.99 
 
 		 508 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.18 
 
 		 350 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 		 474 aa  132  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  27.44 
 
 		 365 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  28.83 
 
 		 335 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  33.56 
 
 		 356 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  27.72 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  31.55 
 
 		 518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1487  DNA-cytosine methyltransferase  34.01 
 
 		 434 aa  127  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  27.07 
 
 		 368 aa  127  5e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  29.7 
 
 		 377 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  26.17 
 
 		 345 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  30.37 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  29.66 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3077  DNA-cytosine methyltransferase  28.25 
 
 		 517 aa  123  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.485404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>