159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2278 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2278  universal stress protein family  100 
 
 		 167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000472572  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2076  hypothetical protein  84.38 
 
 		 164 aa  275  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.969502  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4004  hypothetical protein  65.22 
 
 		 167 aa  213  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1927  UspA domain-containing protein  64.97 
 
 		 165 aa  210  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000483446  hitchhiker  0.0000000000012349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1767  UspA domain-containing protein  66.24 
 
 		 165 aa  210  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000240026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2547  UspA domain-containing protein  64.56 
 
 		 166 aa  207  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.903802  hitchhiker  0.00000022804 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2326  universal stress protein  64.33 
 
 		 165 aa  207  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341198  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3444  UspA domain-containing protein  64.33 
 
 		 165 aa  207  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150899  hitchhiker  0.00194101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41880  universal stress protein  60.13 
 
 		 165 aa  201  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3555  universal stress protein family protein  59.49 
 
 		 165 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  27.85 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  33.33 
 
 		 167 aa  84.3  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  30.19 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3081  UspA domain-containing protein  28.4 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110686  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  27.56 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  26.79 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  28.95 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  31.37 
 
 		 288 aa  57.4  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  30.46 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  28.1 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  30.32 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  28.57 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  26.14 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  26.38 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  26.75 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  25 
 
 		 141 aa  51.6  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  24.52 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  25.93 
 
 		 515 aa  51.2  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  25.81 
 
 		 295 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  26.8 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  23.42 
 
 		 283 aa  50.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  30.13 
 
 		 294 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  26.75 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  27.78 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0913  UspA domain-containing protein  30.32 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  26.51 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  26.75 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  24.18 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  32.97 
 
 		 273 aa  48.5  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  24.84 
 
 		 290 aa  48.5  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0966  UspA domain protein  28.17 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  25.95 
 
 		 285 aa  48.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  25.45 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  29.68 
 
 		 159 aa  48.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  25.16 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  25.66 
 
 		 147 aa  48.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  25 
 
 		 275 aa  47.8  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 		 285 aa  47.8  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  24.39 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  25.16 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  26.51 
 
 		 295 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0071  hypothetical protein  27.22 
 
 		 308 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.677177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  25 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  26.99 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0223  UspA domain protein  26.28 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.189341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  24.36 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  28.4 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  24.03 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  23.87 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  28.03 
 
 		 297 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  30.07 
 
 		 289 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  29.03 
 
 		 287 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0415  UspA domain protein  25.97 
 
 		 296 aa  45.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189257 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  28.22 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  26.11 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  29.25 
 
 		 301 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  25.19 
 
 		 317 aa  45.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  28.22 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  29.94 
 
 		 294 aa  45.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  26.61 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  44.23 
 
 		 282 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 145 aa  44.7  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  25.32 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  24.68 
 
 		 153 aa  44.7  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  25.98 
 
 		 143 aa  44.7  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  30.43 
 
 		 283 aa  44.7  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 143 aa  44.3  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  30.67 
 
 		 155 aa  44.3  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  25 
 
 		 281 aa  44.3  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  24.2 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2622  universal stress protein  28.87 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  28.78 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  29.75 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  24.35 
 
 		 300 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  25.32 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  27.67 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  27.74 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  28.4 
 
 		 308 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  28.23 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  25.17 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0929  UspA domain protein  25.75 
 
 		 326 aa  43.9  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  28.23 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  26.8 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  29.13 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  25.34 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>