More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_25666 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_25666  predicted protein  100 
 
 
885 aa  1845    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04380  WD repeat protein, putative  43.02 
 
 
884 aa  759    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08183  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit (Pwp2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03090)  40.58 
 
 
851 aa  627  1e-178  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.559435  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53071  predicted protein  38.75 
 
 
935 aa  612  9.999999999999999e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0581449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  26.73 
 
 
1523 aa  160  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.47 
 
 
1163 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.97 
 
 
947 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.58 
 
 
1236 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  26.07 
 
 
1454 aa  148  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.13 
 
 
696 aa  147  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.26 
 
 
1652 aa  145  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.41 
 
 
1363 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.45 
 
 
930 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.45 
 
 
1557 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  23.99 
 
 
1510 aa  136  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24.39 
 
 
1364 aa  135  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  24.69 
 
 
1188 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.04 
 
 
1553 aa  131  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.17 
 
 
1831 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.75 
 
 
1481 aa  130  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  22.33 
 
 
1193 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  26.1 
 
 
1443 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  25.09 
 
 
1357 aa  129  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25.09 
 
 
1221 aa  128  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25.14 
 
 
1196 aa  127  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.36 
 
 
1599 aa  125  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.27 
 
 
1686 aa  125  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.05 
 
 
1474 aa  124  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.2 
 
 
1711 aa  121  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  25.34 
 
 
1789 aa  120  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  24.79 
 
 
1901 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.02 
 
 
1004 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.54 
 
 
1856 aa  118  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  22.4 
 
 
1247 aa  117  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.15 
 
 
596 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.53 
 
 
344 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  24.28 
 
 
1161 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  25.69 
 
 
1766 aa  117  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  24.2 
 
 
1217 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  24.28 
 
 
1161 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  25.37 
 
 
608 aa  115  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  27.4 
 
 
464 aa  115  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.87 
 
 
676 aa  114  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.18 
 
 
576 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  21.64 
 
 
1262 aa  113  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.6 
 
 
1868 aa  112  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  24.6 
 
 
1656 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.15 
 
 
919 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.46 
 
 
1607 aa  112  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  21.63 
 
 
728 aa  112  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  29.17 
 
 
742 aa  110  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  32.68 
 
 
774 aa  110  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.41 
 
 
1609 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  27.73 
 
 
443 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  24.47 
 
 
1211 aa  108  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  24.52 
 
 
1714 aa  108  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  24.24 
 
 
1190 aa  107  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.36 
 
 
1760 aa  107  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  24.82 
 
 
1190 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.68 
 
 
740 aa  106  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  22.54 
 
 
505 aa  106  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.34 
 
 
677 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.28 
 
 
1240 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.03 
 
 
792 aa  105  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.19 
 
 
664 aa  104  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  25.84 
 
 
1858 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.09 
 
 
682 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  28.52 
 
 
344 aa  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  21.2 
 
 
1188 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  27.93 
 
 
778 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  22.49 
 
 
1208 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.88 
 
 
642 aa  102  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  22.89 
 
 
1348 aa  101  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  23.62 
 
 
1229 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  21.63 
 
 
1807 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  26.02 
 
 
1280 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  21.16 
 
 
1213 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  27.61 
 
 
1661 aa  99.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.59 
 
 
1583 aa  100  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.13 
 
 
1598 aa  99.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  21.68 
 
 
1411 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.99 
 
 
1684 aa  99  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  21.11 
 
 
1367 aa  98.2  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  30.13 
 
 
1416 aa  97.8  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  25.08 
 
 
564 aa  96.7  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.92 
 
 
630 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  20.8 
 
 
1373 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.45 
 
 
1205 aa  95.9  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  20.04 
 
 
1209 aa  95.9  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  22.18 
 
 
1164 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  27.27 
 
 
434 aa  95.5  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  31.1 
 
 
790 aa  95.5  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  28.08 
 
 
1177 aa  95.5  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  24.32 
 
 
1330 aa  95.1  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  24.14 
 
 
1209 aa  94.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  26.36 
 
 
1334 aa  94.7  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  27.14 
 
 
1041 aa  94.4  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  29.39 
 
 
574 aa  93.6  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  25.1 
 
 
589 aa  94  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.33 
 
 
692 aa  92.8  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>