More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2197 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  546  1e-154  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  54.15 
 
 
265 aa  284  9e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  51.57 
 
 
277 aa  281  9e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  46.3 
 
 
275 aa  252  4e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  47.41 
 
 
267 aa  245  7e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  45.67 
 
 
269 aa  243  2e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1890  Zn-dependent protease  42.48 
 
 
273 aa  240  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  43.27 
 
 
275 aa  234  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  42.46 
 
 
320 aa  219  3e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  43.8 
 
 
262 aa  218  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  42.4 
 
 
274 aa  213  2e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  40.86 
 
 
271 aa  207  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  40.15 
 
 
271 aa  207  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  6.09738e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  41.77 
 
 
284 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  39.13 
 
 
248 aa  197  2e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  6.17052e-06  hitchhiker  6.5256e-06 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  38.99 
 
 
270 aa  196  5e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  38.13 
 
 
278 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  41.2 
 
 
259 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  39.13 
 
 
267 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  3.30567e-07  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  40.8 
 
 
265 aa  175  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  36.6 
 
 
258 aa  174  1e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  37.85 
 
 
270 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  39.75 
 
 
247 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  37.31 
 
 
263 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  37.59 
 
 
280 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  36.88 
 
 
262 aa  170  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  36.47 
 
 
268 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  37.59 
 
 
266 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  7.04965e-06  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  38.82 
 
 
262 aa  168  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  39.68 
 
 
271 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  40.08 
 
 
264 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  36.36 
 
 
269 aa  166  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  34.78 
 
 
274 aa  166  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  36.03 
 
 
293 aa  164  2e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  38 
 
 
266 aa  164  2e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  36.88 
 
 
267 aa  161  9e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  35.96 
 
 
269 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  36.78 
 
 
255 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  35.96 
 
 
269 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  39.36 
 
 
270 aa  159  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  35.96 
 
 
269 aa  159  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  39.15 
 
 
268 aa  159  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  3.10302e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  36.72 
 
 
275 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  36.69 
 
 
270 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  34.73 
 
 
270 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  36.51 
 
 
269 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.65758e-06  hitchhiker  2.97579e-07 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  36.19 
 
 
263 aa  156  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  37.85 
 
 
266 aa  155  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  34.09 
 
 
269 aa  155  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  33.86 
 
 
285 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  36.51 
 
 
269 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  36.51 
 
 
269 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.46898e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0192  peptidase M48, Ste24p  37.34 
 
 
319 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461964  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  36.88 
 
 
289 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51059e-07 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  44.05 
 
 
231 aa  153  3e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  37.04 
 
 
272 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  34.53 
 
 
271 aa  152  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  37.04 
 
 
279 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  36.11 
 
 
269 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.56254e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  35.55 
 
 
268 aa  152  6e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  37.04 
 
 
272 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  35.48 
 
 
272 aa  151  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.66595e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  34.96 
 
 
291 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  34.96 
 
 
311 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  37.41 
 
 
271 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  39.92 
 
 
273 aa  148  1e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  36.14 
 
 
266 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  4.70092e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  39.92 
 
 
273 aa  146  4e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  33.76 
 
 
272 aa  145  7e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  36.57 
 
 
282 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  36.19 
 
 
272 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  34.09 
 
 
268 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  36.9 
 
 
284 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  33.46 
 
 
268 aa  143  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  43.65 
 
 
273 aa  142  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  37.14 
 
 
284 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0006  peptidase M48 Ste24p  35 
 
 
268 aa  140  2e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889597 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  34.46 
 
 
268 aa  140  2e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  2.69933e-07 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  43.09 
 
 
272 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  35.95 
 
 
280 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3668  peptidase M48, Ste24p  35.71 
 
 
273 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  34.4 
 
 
268 aa  136  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  32.7 
 
 
305 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  40.11 
 
 
281 aa  135  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2637  peptidase M48, Ste24p  34.41 
 
 
302 aa  134  1e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2760  peptidase M48 Ste24p  36.24 
 
 
298 aa  133  2e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.293753  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0153  putative signal peptide protein  31.6 
 
 
314 aa  134  2e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700817  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
432 aa  132  8e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  32 
 
 
376 aa  131  1e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  31.16 
 
 
268 aa  131  1e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  29.82 
 
 
268 aa  131  1e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  2.40796e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  31.29 
 
 
254 aa  130  2e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  3.19394e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0093  putative signal peptide protein  34.41 
 
 
340 aa  129  4e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485946  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  36.1 
 
 
288 aa  129  4e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  31.66 
 
 
264 aa  129  4e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0043  peptidase M48 Ste24p  36.22 
 
 
314 aa  129  4e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0046  peptidase M48 Ste24p  35.68 
 
 
314 aa  129  7e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.330738 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  32.18 
 
 
504 aa  128  1e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06650  conserved hypothetical protein  40.91 
 
 
418 aa  127  2e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179039  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0153  peptidase M48, Ste24p  34.47 
 
 
280 aa  126  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0497682  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>