More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_13470 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 293 aa  593  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  96.93 
 
 		 293 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 291 aa  298  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  54.98 
 
 		 290 aa  298  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  53.1 
 
 		 291 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  53.66 
 
 		 291 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 291 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  53.31 
 
 		 291 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  51.38 
 
 		 291 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 291 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 305 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  48.78 
 
 		 324 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  50.9 
 
 		 346 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  50.71 
 
 		 301 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  48.07 
 
 		 305 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  50.18 
 
 		 327 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  48.07 
 
 		 305 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  49.82 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  49.82 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 311 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 311 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 291 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 315 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 678 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2555  AraC family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0708  AraC family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 311 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0725  AraC family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 311 aa  234  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  45.49 
 
 		 306 aa  218  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  42.71 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  39.45 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  39.6 
 
 		 322 aa  195  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  37.11 
 
 		 291 aa  185  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  35.13 
 
 		 287 aa  185  8e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  35.13 
 
 		 287 aa  185  8e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  34.77 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 289 aa  182  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5208  AraC family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 314 aa  178  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  36.3 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  36.33 
 
 		 305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  35.31 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  36.7 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  30.32 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  43.42 
 
 		 295 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 296 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  36.31 
 
 		 300 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  31.73 
 
 		 331 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4687  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 287 aa  95.9  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 154 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 361 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  33.92 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 305 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  28.28 
 
 		 296 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  29.84 
 
 		 297 aa  92  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  29.86 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  29.05 
 
 		 304 aa  90.1  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 287 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  28.02 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 276 aa  89.7  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 304 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  29.49 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 322 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  30.15 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  39.81 
 
 		 180 aa  86.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 277 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 301 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 301 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  30.89 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  43.14 
 
 		 287 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  42 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2811  transcriptional regulator, AraC family  28.91 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 513 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>