More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2885 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
705 aa  1450    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  42.14 
 
 
668 aa  518  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  39.53 
 
 
649 aa  430  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  37.2 
 
 
661 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  37.33 
 
 
648 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  36.38 
 
 
681 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  36.08 
 
 
683 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2797  penicillin-binding protein, 1A family  36.8 
 
 
677 aa  366  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  35.85 
 
 
806 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  34.03 
 
 
683 aa  362  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  37.05 
 
 
843 aa  359  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  35.27 
 
 
829 aa  355  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  35.28 
 
 
683 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  37.75 
 
 
656 aa  352  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  35.77 
 
 
667 aa  352  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  35.11 
 
 
662 aa  350  5e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  36.25 
 
 
761 aa  349  8e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  35.11 
 
 
704 aa  348  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  34.8 
 
 
683 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  34.8 
 
 
683 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  34.63 
 
 
683 aa  347  6e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  34.59 
 
 
683 aa  345  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  35.94 
 
 
643 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  35.21 
 
 
905 aa  344  2.9999999999999997e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  33.58 
 
 
765 aa  344  4e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  34.43 
 
 
683 aa  343  9e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  34.43 
 
 
683 aa  342  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  34.86 
 
 
693 aa  342  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  34.43 
 
 
683 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  35.53 
 
 
766 aa  340  5e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  34.43 
 
 
683 aa  340  8e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  34.34 
 
 
727 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  34.43 
 
 
683 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  33.98 
 
 
824 aa  334  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  32.15 
 
 
814 aa  332  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  31.52 
 
 
750 aa  332  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  35.73 
 
 
757 aa  332  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  37.36 
 
 
691 aa  331  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  34.01 
 
 
655 aa  330  6e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  33.75 
 
 
720 aa  330  7e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  35.19 
 
 
744 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  33.12 
 
 
646 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  36.51 
 
 
626 aa  328  3e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  35.19 
 
 
701 aa  327  5e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  32.22 
 
 
642 aa  325  2e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  36.88 
 
 
643 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  36.88 
 
 
643 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  35.34 
 
 
654 aa  322  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  35.4 
 
 
775 aa  320  6e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  33.63 
 
 
828 aa  320  7e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  35.66 
 
 
811 aa  320  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  34.28 
 
 
739 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  35.95 
 
 
824 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  34.08 
 
 
705 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  31.88 
 
 
774 aa  318  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  34.12 
 
 
734 aa  317  6e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  35.78 
 
 
824 aa  316  8e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  35.05 
 
 
735 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  32.02 
 
 
642 aa  315  1.9999999999999998e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  33.77 
 
 
776 aa  313  4.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  33.23 
 
 
720 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  35.44 
 
 
761 aa  313  6.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  32.94 
 
 
727 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  36.25 
 
 
714 aa  313  9e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  35.23 
 
 
734 aa  312  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  35.84 
 
 
860 aa  312  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  32.57 
 
 
751 aa  312  2e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  35.02 
 
 
714 aa  310  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  33.75 
 
 
718 aa  310  8e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  32.81 
 
 
618 aa  310  8e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  31.93 
 
 
648 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  34.29 
 
 
727 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  32.17 
 
 
638 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  35.66 
 
 
727 aa  308  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  33.59 
 
 
732 aa  306  6e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  31.87 
 
 
890 aa  306  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  34.71 
 
 
728 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  33.58 
 
 
665 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  33.95 
 
 
712 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  34.89 
 
 
757 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  35.3 
 
 
853 aa  304  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  33.28 
 
 
741 aa  304  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  36.11 
 
 
651 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  32.1 
 
 
759 aa  301  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  33.17 
 
 
643 aa  301  3e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  33.17 
 
 
643 aa  300  5e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  33.17 
 
 
643 aa  300  5e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  34.78 
 
 
728 aa  300  8e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  33.39 
 
 
640 aa  299  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  33.71 
 
 
833 aa  299  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  33.63 
 
 
640 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  33.7 
 
 
641 aa  298  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  35.43 
 
 
712 aa  298  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  31.43 
 
 
730 aa  298  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  32.01 
 
 
880 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  30.52 
 
 
795 aa  298  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  30.26 
 
 
752 aa  298  3e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  30.19 
 
 
941 aa  298  3e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  35.31 
 
 
709 aa  297  4e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  33.12 
 
 
658 aa  297  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>