More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0063 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  50.47 
 
 		 941 aa  927    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  50.47 
 
 		 941 aa  927    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 962 aa  1961    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  58.95 
 
 		 933 aa  1116    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  58.69 
 
 		 969 aa  1113    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  52.99 
 
 		 966 aa  986    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  32.1 
 
 		 972 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  34.87 
 
 		 1129 aa  305  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  34.61 
 
 		 1116 aa  298  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  32.52 
 
 		 988 aa  268  4e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  32.5 
 
 		 1144 aa  267  5.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  32.5 
 
 		 835 aa  267  8e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  33.14 
 
 		 1194 aa  261  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  32.7 
 
 		 1172 aa  261  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  31.25 
 
 		 1138 aa  260  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  34.29 
 
 		 1147 aa  258  5e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  32.14 
 
 		 925 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  33.74 
 
 		 1062 aa  255  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  31.95 
 
 		 922 aa  252  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  31.3 
 
 		 1145 aa  252  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  32.73 
 
 		 969 aa  251  7e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  32.84 
 
 		 801 aa  249  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  33.49 
 
 		 805 aa  249  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  31.35 
 
 		 877 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  33.45 
 
 		 971 aa  244  7.999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  30.75 
 
 		 927 aa  241  4e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  32.26 
 
 		 1167 aa  240  9e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  30.75 
 
 		 1169 aa  239  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  33.17 
 
 		 1169 aa  239  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  32.76 
 
 		 964 aa  239  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  32.35 
 
 		 1172 aa  238  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  32.06 
 
 		 1167 aa  238  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  34.34 
 
 		 1167 aa  238  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  31.39 
 
 		 1170 aa  237  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  32.4 
 
 		 1170 aa  235  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  32.67 
 
 		 1170 aa  233  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  30.11 
 
 		 1136 aa  233  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  31.43 
 
 		 1160 aa  232  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  31.48 
 
 		 829 aa  231  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  30.62 
 
 		 1168 aa  230  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  29.26 
 
 		 1137 aa  228  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  30.45 
 
 		 1170 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.32 
 
 		 1212 aa  219  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  32.98 
 
 		 919 aa  214  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  28.82 
 
 		 937 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  32.93 
 
 		 1160 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  30.64 
 
 		 1038 aa  209  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  32.36 
 
 		 1049 aa  207  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  28.29 
 
 		 572 aa  206  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  31.24 
 
 		 1057 aa  201  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  27.13 
 
 		 560 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  30.22 
 
 		 963 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  27.13 
 
 		 560 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  27.13 
 
 		 560 aa  198  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  27.13 
 
 		 560 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  27.13 
 
 		 560 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  27.13 
 
 		 560 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  27.13 
 
 		 560 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  26.96 
 
 		 560 aa  197  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  27.18 
 
 		 560 aa  196  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  30.95 
 
 		 1165 aa  196  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  26.96 
 
 		 560 aa  195  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  31.32 
 
 		 1031 aa  195  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  27.99 
 
 		 555 aa  194  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  29.08 
 
 		 900 aa  194  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  30.99 
 
 		 578 aa  194  9e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  29.86 
 
 		 894 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  30.81 
 
 		 915 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  30.81 
 
 		 916 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  26.43 
 
 		 560 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  30.65 
 
 		 915 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  30.51 
 
 		 1069 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  30.51 
 
 		 1069 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  28.55 
 
 		 1201 aa  191  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  28.55 
 
 		 1201 aa  191  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  29.31 
 
 		 963 aa  191  7e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  29.11 
 
 		 1058 aa  191  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  30.31 
 
 		 1045 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  29.9 
 
 		 921 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  29.24 
 
 		 1046 aa  188  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  30.29 
 
 		 1044 aa  188  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.97 
 
 		 1028 aa  188  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  27.81 
 
 		 967 aa  188  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  26.89 
 
 		 584 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  28.71 
 
 		 1095 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  30.77 
 
 		 947 aa  184  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  29.82 
 
 		 949 aa  183  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  29.02 
 
 		 964 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  28.43 
 
 		 665 aa  183  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  28.77 
 
 		 932 aa  181  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  28.85 
 
 		 960 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  27.76 
 
 		 951 aa  179  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  31.01 
 
 		 955 aa  178  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  28.47 
 
 		 952 aa  177  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  26.94 
 
 		 584 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  27.93 
 
 		 966 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  29.59 
 
 		 1177 aa  171  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  26.19 
 
 		 1013 aa  171  9e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  30.33 
 
 		 950 aa  171  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.71 
 
 		 961 aa  167  8e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>