More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3404 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 586 aa  1186    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  55.85 
 
 		 556 aa  565  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  54.2 
 
 		 569 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  40.93 
 
 		 537 aa  325  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  39.68 
 
 		 536 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  39.68 
 
 		 536 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  39.68 
 
 		 536 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  31.34 
 
 		 584 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.86 
 
 		 575 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.68 
 
 		 575 aa  212  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  31.28 
 
 		 583 aa  212  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  31.51 
 
 		 601 aa  206  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  34.95 
 
 		 538 aa  200  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  32.71 
 
 		 542 aa  191  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  31.12 
 
 		 556 aa  188  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  30.14 
 
 		 601 aa  187  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  31.56 
 
 		 590 aa  183  8.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  30.47 
 
 		 604 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  33.62 
 
 		 554 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  31.67 
 
 		 547 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  32.74 
 
 		 537 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  29.31 
 
 		 624 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  31.2 
 
 		 552 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  31.77 
 
 		 553 aa  173  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  31.95 
 
 		 555 aa  171  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  32.7 
 
 		 555 aa  170  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  32.22 
 
 		 539 aa  169  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  31.15 
 
 		 547 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  30.58 
 
 		 544 aa  167  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  30.07 
 
 		 581 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  29 
 
 		 581 aa  162  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  30.57 
 
 		 542 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  28.14 
 
 		 638 aa  160  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  31.1 
 
 		 547 aa  160  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  30.49 
 
 		 545 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  28.23 
 
 		 577 aa  158  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  29.68 
 
 		 564 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  29.17 
 
 		 587 aa  157  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  30.78 
 
 		 648 aa  153  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  31.26 
 
 		 548 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  31.21 
 
 		 650 aa  150  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  25.98 
 
 		 576 aa  150  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  25.98 
 
 		 597 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  29.01 
 
 		 554 aa  146  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  29.74 
 
 		 625 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  29.07 
 
 		 560 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  26.9 
 
 		 603 aa  142  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  31.45 
 
 		 525 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  30.02 
 
 		 549 aa  137  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.04 
 
 		 540 aa  136  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  26.48 
 
 		 563 aa  135  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  26.58 
 
 		 585 aa  134  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  26.56 
 
 		 618 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  28.1 
 
 		 569 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.35 
 
 		 544 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  27.75 
 
 		 556 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  26.25 
 
 		 626 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  24.65 
 
 		 520 aa  131  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  26.5 
 
 		 544 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.44 
 
 		 560 aa  130  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  28.7 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  28.04 
 
 		 533 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  30.58 
 
 		 537 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  29.93 
 
 		 553 aa  128  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  26.6 
 
 		 592 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  28.19 
 
 		 568 aa  127  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  28.92 
 
 		 543 aa  126  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  29.6 
 
 		 548 aa  126  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  27.72 
 
 		 569 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  26.2 
 
 		 548 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  26.95 
 
 		 619 aa  125  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  26.92 
 
 		 550 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.48 
 
 		 556 aa  124  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  28.64 
 
 		 564 aa  124  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  27.37 
 
 		 620 aa  123  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  26 
 
 		 543 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  25.59 
 
 		 543 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  28.85 
 
 		 543 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  28.37 
 
 		 552 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.85 
 
 		 583 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.48 
 
 		 556 aa  120  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  28.99 
 
 		 564 aa  120  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  26.38 
 
 		 557 aa  120  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  25 
 
 		 505 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2102  amidohydrolase 3  26.57 
 
 		 928 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  26.43 
 
 		 565 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  28.38 
 
 		 546 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  26.18 
 
 		 527 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  25.15 
 
 		 553 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  25.34 
 
 		 596 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  29.21 
 
 		 544 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  25.9 
 
 		 608 aa  117  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  25.17 
 
 		 539 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  25.67 
 
 		 522 aa  117  7.999999999999999e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  27.06 
 
 		 573 aa  116  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  28.88 
 
 		 532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.77 
 
 		 565 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  25.98 
 
 		 583 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  25.98 
 
 		 583 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  25.82 
 
 		 545 aa  115  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>