207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2102 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2102  amidohydrolase 3  100 
 
 		 928 aa  1930    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  42.23 
 
 		 618 aa  529  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  36.8 
 
 		 626 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  30.39 
 
 		 584 aa  252  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.2 
 
 		 575 aa  240  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.2 
 
 		 575 aa  239  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  28.64 
 
 		 583 aa  225  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  29.74 
 
 		 601 aa  220  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  25.12 
 
 		 581 aa  148  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  26.01 
 
 		 625 aa  145  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  26.07 
 
 		 585 aa  140  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  24.77 
 
 		 563 aa  136  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1989  amidohydrolase 3  25.71 
 
 		 737 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.829249  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  24.96 
 
 		 542 aa  133  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  24.92 
 
 		 547 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  24.8 
 
 		 601 aa  125  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  24.28 
 
 		 587 aa  124  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  26.23 
 
 		 604 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  28.04 
 
 		 554 aa  123  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1877  amidohydrolase 3  29.06 
 
 		 736 aa  121  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.393763  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  25.83 
 
 		 537 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  26.57 
 
 		 586 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  24.96 
 
 		 547 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  24.62 
 
 		 581 aa  117  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  23.16 
 
 		 552 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  27.05 
 
 		 548 aa  114  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  24.94 
 
 		 536 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  24.94 
 
 		 536 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  24.94 
 
 		 536 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  23.33 
 
 		 545 aa  111  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  29.64 
 
 		 592 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  24.1 
 
 		 547 aa  109  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  24.39 
 
 		 539 aa  109  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  30.8 
 
 		 548 aa  109  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  23.71 
 
 		 557 aa  105  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  21.95 
 
 		 555 aa  103  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  28.89 
 
 		 538 aa  103  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  23.17 
 
 		 540 aa  102  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  28.4 
 
 		 525 aa  102  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  22.96 
 
 		 555 aa  100  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  25.08 
 
 		 648 aa  99.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  25.27 
 
 		 544 aa  98.2  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  22.46 
 
 		 554 aa  97.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  27.3 
 
 		 556 aa  97.4  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  22.93 
 
 		 590 aa  95.9  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  23.23 
 
 		 650 aa  95.5  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  24.64 
 
 		 543 aa  93.6  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  24.32 
 
 		 556 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  26.65 
 
 		 557 aa  92.4  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  28.66 
 
 		 539 aa  92.8  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  22.55 
 
 		 562 aa  91.7  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  23.39 
 
 		 564 aa  90.9  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  23.79 
 
 		 541 aa  90.9  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  23.52 
 
 		 543 aa  90.5  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  22.27 
 
 		 553 aa  90.1  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  22.8 
 
 		 530 aa  90.1  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  23.47 
 
 		 539 aa  89  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  23.83 
 
 		 543 aa  88.6  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  23.55 
 
 		 589 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  26.99 
 
 		 543 aa  87  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  27.11 
 
 		 505 aa  87.4  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  26.74 
 
 		 537 aa  85.9  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  25.98 
 
 		 620 aa  85.5  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  30.35 
 
 		 541 aa  84  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  25.21 
 
 		 553 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  25.68 
 
 		 603 aa  83.2  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.57 
 
 		 540 aa  83.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  26.39 
 
 		 540 aa  82  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  28.81 
 
 		 580 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  28.81 
 
 		 580 aa  81.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  21.47 
 
 		 577 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  22.62 
 
 		 544 aa  80.1  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  27.2 
 
 		 549 aa  79.3  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  25.88 
 
 		 574 aa  78.2  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  26.21 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  25.55 
 
 		 569 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  23.14 
 
 		 537 aa  77.4  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  26.95 
 
 		 569 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  22.95 
 
 		 596 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  23.93 
 
 		 543 aa  76.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  23.93 
 
 		 583 aa  76.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  23.93 
 
 		 583 aa  76.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.83 
 
 		 560 aa  75.5  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  22.09 
 
 		 539 aa  75.5  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25 
 
 		 565 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  25.68 
 
 		 527 aa  75.1  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  25.89 
 
 		 564 aa  74.7  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  26.7 
 
 		 552 aa  74.7  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  23.65 
 
 		 546 aa  73.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  22.49 
 
 		 541 aa  73.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  23.13 
 
 		 606 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  22.17 
 
 		 582 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  28.88 
 
 		 527 aa  72.8  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  23.08 
 
 		 585 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  23.78 
 
 		 550 aa  72  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  23.28 
 
 		 556 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  19.81 
 
 		 541 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  23.8 
 
 		 557 aa  69.7  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  25.43 
 
 		 550 aa  69.7  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  27.78 
 
 		 553 aa  70.1  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>