205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1989 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1989  amidohydrolase 3  100 
 
 
737 aa  1529    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.829249  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1877  amidohydrolase 3  98.1 
 
 
736 aa  1496    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.393763  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.12 
 
 
575 aa  161  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.98 
 
 
575 aa  159  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  29.63 
 
 
584 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  34.89 
 
 
583 aa  140  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  26.66 
 
 
581 aa  124  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2102  amidohydrolase 3  28.74 
 
 
928 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  28.75 
 
 
626 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  26.11 
 
 
618 aa  118  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  28.01 
 
 
601 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  24.51 
 
 
581 aa  110  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  25.24 
 
 
585 aa  108  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  28.12 
 
 
592 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  28.42 
 
 
563 aa  104  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  28.77 
 
 
547 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  28.8 
 
 
603 aa  103  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  29.43 
 
 
547 aa  101  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  24.93 
 
 
625 aa  95.5  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  29.28 
 
 
554 aa  94.7  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  24.94 
 
 
537 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  24.11 
 
 
597 aa  92.8  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  26.34 
 
 
547 aa  92.4  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  27.44 
 
 
538 aa  88.6  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  31 
 
 
557 aa  88.6  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  29.93 
 
 
545 aa  87.8  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  27.58 
 
 
533 aa  87.4  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  23.83 
 
 
573 aa  86.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  27.34 
 
 
555 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  27.27 
 
 
536 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  27.27 
 
 
536 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  27.27 
 
 
536 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  29.39 
 
 
548 aa  84.7  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  26.21 
 
 
542 aa  83.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  25.33 
 
 
606 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  26.73 
 
 
601 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  25.5 
 
 
586 aa  81.6  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  28.25 
 
 
604 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  24.32 
 
 
638 aa  80.9  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  27.44 
 
 
552 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  29.46 
 
 
555 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  25.71 
 
 
587 aa  80.5  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  30.91 
 
 
544 aa  79.7  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  23.94 
 
 
576 aa  78.2  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  25.5 
 
 
620 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  24.14 
 
 
542 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  26.79 
 
 
554 aa  75.5  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  26.24 
 
 
577 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  28.73 
 
 
648 aa  75.1  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  26.76 
 
 
537 aa  75.1  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  26.26 
 
 
573 aa  75.5  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  23.87 
 
 
553 aa  74.7  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  23.87 
 
 
616 aa  74.7  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0578  amidohydrolase 3  27.05 
 
 
545 aa  74.7  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  23.26 
 
 
564 aa  74.7  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  26.03 
 
 
546 aa  73.9  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  25.07 
 
 
543 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  25.07 
 
 
583 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  25.07 
 
 
583 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  23.85 
 
 
596 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  24.73 
 
 
624 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  24.28 
 
 
576 aa  72  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  25.31 
 
 
549 aa  72  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  27.08 
 
 
539 aa  71.6  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  22.9 
 
 
557 aa  71.6  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  23.67 
 
 
548 aa  71.2  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  23.79 
 
 
569 aa  70.9  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  26.63 
 
 
556 aa  70.1  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  27.3 
 
 
650 aa  70.1  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  24.59 
 
 
525 aa  69.7  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  27.55 
 
 
544 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  25.83 
 
 
545 aa  68.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  23.63 
 
 
560 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  23.34 
 
 
560 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.89 
 
 
544 aa  66.6  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  27.47 
 
 
543 aa  66.6  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  26.44 
 
 
569 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  24.44 
 
 
563 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  24.44 
 
 
563 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  25.89 
 
 
527 aa  65.5  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  24.75 
 
 
574 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  27.48 
 
 
589 aa  64.3  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.32 
 
 
560 aa  64.3  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  23.08 
 
 
564 aa  63.9  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  23.3 
 
 
564 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  24.44 
 
 
568 aa  62.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  26.18 
 
 
556 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  26.69 
 
 
569 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  24.37 
 
 
569 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  27.48 
 
 
535 aa  63.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22680  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.82 
 
 
543 aa  61.6  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  24.23 
 
 
563 aa  59.3  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.3 
 
 
540 aa  59.3  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  23.13 
 
 
564 aa  59.7  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  22.86 
 
 
522 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  32 
 
 
582 aa  58.9  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  23.58 
 
 
563 aa  58.5  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  23.02 
 
 
522 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  22.86 
 
 
576 aa  57.8  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  22.71 
 
 
539 aa  57.8  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>