218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1877 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1989  amidohydrolase 3  98.1 
 
 		 737 aa  1496    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.829249  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1877  amidohydrolase 3  100 
 
 		 736 aa  1528    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.393763  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.88 
 
 		 575 aa  163  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.73 
 
 		 575 aa  162  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  30.45 
 
 		 584 aa  145  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  35.97 
 
 		 583 aa  140  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  29.7 
 
 		 626 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  26.66 
 
 		 581 aa  125  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2102  amidohydrolase 3  29.06 
 
 		 928 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  28.65 
 
 		 601 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  26.46 
 
 		 618 aa  118  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  25.32 
 
 		 585 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  27.95 
 
 		 592 aa  107  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  30.31 
 
 		 554 aa  104  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  28.47 
 
 		 563 aa  103  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  29.23 
 
 		 547 aa  102  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  29.06 
 
 		 547 aa  102  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  28.65 
 
 		 603 aa  101  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  26.72 
 
 		 581 aa  99  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  31.85 
 
 		 557 aa  95.9  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  25 
 
 		 537 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  26.98 
 
 		 625 aa  95.5  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  26.15 
 
 		 547 aa  92.8  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  23.53 
 
 		 597 aa  92  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  29.67 
 
 		 545 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  26.81 
 
 		 538 aa  89.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  29.6 
 
 		 555 aa  89  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  27.02 
 
 		 536 aa  87.4  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  30.66 
 
 		 544 aa  87.4  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  27.02 
 
 		 536 aa  87.4  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  27.02 
 
 		 536 aa  87.4  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  29.14 
 
 		 548 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  26.41 
 
 		 542 aa  86.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  23.65 
 
 		 573 aa  87  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  26.75 
 
 		 587 aa  86.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  27.53 
 
 		 533 aa  85.5  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  27.23 
 
 		 601 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  27.81 
 
 		 604 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  23.2 
 
 		 576 aa  83.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  29.15 
 
 		 555 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  27.54 
 
 		 552 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  23.42 
 
 		 564 aa  82.8  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  25.57 
 
 		 586 aa  81.6  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  27.22 
 
 		 577 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  27.53 
 
 		 537 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0578  amidohydrolase 3  28.21 
 
 		 545 aa  79.3  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  26.88 
 
 		 554 aa  79  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  23.84 
 
 		 638 aa  79.3  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  23.21 
 
 		 557 aa  77.8  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  26.11 
 
 		 546 aa  77.4  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  25.99 
 
 		 573 aa  77.4  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  25.94 
 
 		 606 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  23.88 
 
 		 569 aa  75.5  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  24.68 
 
 		 542 aa  75.5  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  29.56 
 
 		 648 aa  75.1  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  25.63 
 
 		 624 aa  74.3  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  28.11 
 
 		 650 aa  74.3  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  25.31 
 
 		 549 aa  74.3  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  24.7 
 
 		 616 aa  74.3  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  26.45 
 
 		 539 aa  72.8  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  25 
 
 		 576 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  27.17 
 
 		 543 aa  72.8  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  26.4 
 
 		 620 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  26.14 
 
 		 556 aa  71.6  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  23.62 
 
 		 553 aa  72  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  24.79 
 
 		 543 aa  71.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  23.73 
 
 		 548 aa  71.2  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  24.79 
 
 		 583 aa  71.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  24.79 
 
 		 583 aa  71.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  25.98 
 
 		 545 aa  70.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  25.63 
 
 		 525 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.05 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  27.55 
 
 		 544 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  23.14 
 
 		 564 aa  68.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  23.85 
 
 		 596 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  26.58 
 
 		 569 aa  67.4  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  26.33 
 
 		 527 aa  67.4  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22680  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.36 
 
 		 543 aa  67.4  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  24.51 
 
 		 568 aa  66.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  24.23 
 
 		 563 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  23.36 
 
 		 564 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  24.23 
 
 		 563 aa  65.5  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  27.6 
 
 		 589 aa  65.1  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  25.34 
 
 		 574 aa  64.3  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  23.85 
 
 		 560 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.55 
 
 		 560 aa  62.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  24.01 
 
 		 569 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  27.16 
 
 		 535 aa  62.4  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  23.85 
 
 		 560 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  24.3 
 
 		 563 aa  62  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  24.09 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  26.86 
 
 		 582 aa  61.6  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  24.18 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  26.35 
 
 		 537 aa  60.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.65 
 
 		 540 aa  60.1  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  24.52 
 
 		 551 aa  60.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  25.48 
 
 		 556 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  23.81 
 
 		 522 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  22.67 
 
 		 576 aa  60.1  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  24.91 
 
 		 564 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>