214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1503 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  63.13 
 
 		 569 aa  753    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 649 aa  1352    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  37.56 
 
 		 668 aa  399  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  33.63 
 
 		 670 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  32.88 
 
 		 647 aa  353  5e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  35.16 
 
 		 663 aa  343  4e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  32.59 
 
 		 645 aa  340  4e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  32.06 
 
 		 615 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  33.63 
 
 		 650 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  32.78 
 
 		 622 aa  306  7e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  30.04 
 
 		 615 aa  269  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  26.59 
 
 		 644 aa  221  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  28.18 
 
 		 644 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  26.92 
 
 		 627 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  26.44 
 
 		 621 aa  187  6e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  26.52 
 
 		 642 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  25.97 
 
 		 621 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  25.37 
 
 		 621 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  25.26 
 
 		 621 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  27.7 
 
 		 647 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  26.95 
 
 		 604 aa  167  5.9999999999999996e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  24.85 
 
 		 673 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  27.33 
 
 		 611 aa  147  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  26.32 
 
 		 602 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0566  glycoside hydrolase 15-related protein  26.6 
 
 		 584 aa  105  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.941265  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  25.49 
 
 		 610 aa  95.1  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0758  glycoside hydrolase 15-related  23.85 
 
 		 363 aa  86.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.628366  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1322  glycoside hydrolase 15-related  24.39 
 
 		 565 aa  81.6  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.033472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  24.71 
 
 		 622 aa  78.6  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  27.15 
 
 		 592 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0989  glycoside hydrolase 15-related  22.05 
 
 		 583 aa  75.9  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.422576  normal  0.0726488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  24.93 
 
 		 596 aa  75.1  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  24.35 
 
 		 599 aa  74.3  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0235  glycoside hydrolase 15-related  24.86 
 
 		 599 aa  73.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  26.63 
 
 		 592 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  23.35 
 
 		 619 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  24.29 
 
 		 620 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  23.1 
 
 		 619 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0554  glycoside hydrolase 15-related protein  20.59 
 
 		 578 aa  68.9  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000579959  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2413  glycoside hydrolase 15-related  28.93 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3889  glycoside hydrolase 15-related protein  31.75 
 
 		 893 aa  68.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0219  glycoside hydrolase 15-related  25.3 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0997463  hitchhiker  0.0053447 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  25.6 
 
 		 610 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 		 610 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  25.6 
 
 		 610 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  25.6 
 
 		 610 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  25.6 
 
 		 610 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  25.6 
 
 		 610 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  25.6 
 
 		 610 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  28.36 
 
 		 677 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  28.36 
 
 		 677 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4222  glycoside hydrolase 15-related protein  25.59 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1640  glycoside hydrolase 15-related  28.79 
 
 		 887 aa  67.8  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  25.47 
 
 		 610 aa  67.4  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  28.36 
 
 		 677 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0399  glucoamylase-related protein, trehalase  24.32 
 
 		 593 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3680  glycoside hydrolase 15-related  31.75 
 
 		 876 aa  66.6  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  28.36 
 
 		 642 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  23.01 
 
 		 605 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3218  glycoside hydrolase 15-related protein  30.2 
 
 		 629 aa  66.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  24.36 
 
 		 597 aa  66.2  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31600  glycosyl hydrolase, glucoamylase  25 
 
 		 549 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.618775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  21.07 
 
 		 593 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  26.46 
 
 		 586 aa  65.1  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  26.11 
 
 		 597 aa  64.3  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  24.66 
 
 		 608 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  24.94 
 
 		 629 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.08 
 
 		 858 aa  64.3  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  24.07 
 
 		 609 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.04 
 
 		 801 aa  63.9  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  25.67 
 
 		 609 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  23.61 
 
 		 611 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  25.67 
 
 		 609 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  25.67 
 
 		 609 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2935  glycoside hydrolase 15-related protein  28.02 
 
 		 617 aa  62.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  28.71 
 
 		 636 aa  62.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0817  glycoside hydrolase 15-related protein  26.25 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.47489 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.75 
 
 		 858 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  27.18 
 
 		 596 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  22.14 
 
 		 594 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.75 
 
 		 858 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  25.6 
 
 		 598 aa  62.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  22.13 
 
 		 605 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  24.86 
 
 		 617 aa  62  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  24.8 
 
 		 609 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  24.19 
 
 		 609 aa  62  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  24.87 
 
 		 599 aa  62  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  24.48 
 
 		 598 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  26.37 
 
 		 672 aa  62  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  26.7 
 
 		 894 aa  61.6  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  24.41 
 
 		 592 aa  61.2  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  23.91 
 
 		 629 aa  61.6  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  25.87 
 
 		 662 aa  61.2  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20130  glycosyl hydrolase, glucoamylase  25.2 
 
 		 643 aa  60.8  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937874  normal  0.58704 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  23.43 
 
 		 597 aa  60.5  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.95 
 
 		 777 aa  60.1  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.64 
 
 		 841 aa  60.1  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.6 
 
 		 821 aa  60.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  23.89 
 
 		 595 aa  60.1  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0874  glycoside hydrolase 15-related protein  27.84 
 
 		 645 aa  60.1  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219987  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>