203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0223 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3490  ATPase  53.64 
 
 		 640 aa  653    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.622466  normal  0.276666 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1791  ATPase  53.52 
 
 		 618 aa  655    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00115762  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  100 
 
 		 602 aa  1196    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  51.45 
 
 		 625 aa  606  9.999999999999999e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  50.8 
 
 		 631 aa  595  1e-169  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  50.16 
 
 		 629 aa  584  1.0000000000000001e-165  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  49.92 
 
 		 633 aa  580  1e-164  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0722  ATPase  48.97 
 
 		 633 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0212836  normal  0.622935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  44.73 
 
 		 658 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  48.87 
 
 		 634 aa  570  1e-161  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  46.32 
 
 		 642 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  46.02 
 
 		 631 aa  557  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  45.31 
 
 		 630 aa  543  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  45.63 
 
 		 630 aa  545  1e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  45.63 
 
 		 630 aa  542  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1247  ATPase  45.7 
 
 		 651 aa  543  1e-153  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  42.64 
 
 		 655 aa  527  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  44.07 
 
 		 605 aa  503  1e-141  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  40.99 
 
 		 671 aa  489  1e-137  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0622  PilT protein domain protein  45.06 
 
 		 597 aa  479  1e-134  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0536  ATPase  43.07 
 
 		 530 aa  397  1e-109  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1639  Nucleotide binding protein PINc  39.48 
 
 		 510 aa  377  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.917649  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1101  ATPase  41.63 
 
 		 517 aa  367  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0298  ATPase  41.14 
 
 		 521 aa  363  5.0000000000000005e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.350662  normal  0.0582555 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1925  ATPase  38.64 
 
 		 506 aa  363  6e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1721  ATPase  40.27 
 
 		 518 aa  350  5e-95  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0370491  decreased coverage  0.0000123614 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0407  ATPase  38.93 
 
 		 520 aa  347  3e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1385  ATPase  38.79 
 
 		 519 aa  345  2e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  31.65 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  31.01 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  34.15 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  33.11 
 
 		 455 aa  57  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  28.31 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  27.63 
 
 		 445 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  27.3 
 
 		 451 aa  55.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  31.4 
 
 		 452 aa  55.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  28.89 
 
 		 423 aa  55.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  32.45 
 
 		 454 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  32.45 
 
 		 454 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  32.45 
 
 		 454 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  30.16 
 
 		 469 aa  55.1  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  32.62 
 
 		 453 aa  55.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  29.65 
 
 		 445 aa  55.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  27.41 
 
 		 423 aa  54.7  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  32.37 
 
 		 472 aa  54.3  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  33.6 
 
 		 492 aa  54.3  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  30.86 
 
 		 464 aa  53.5  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  29.37 
 
 		 428 aa  53.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  27.42 
 
 		 492 aa  53.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  30.15 
 
 		 468 aa  52.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3656  PilT domain-containing protein  31.62 
 
 		 346 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  29.37 
 
 		 428 aa  53.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  29.37 
 
 		 428 aa  53.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  27.22 
 
 		 454 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  33.6 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  29.69 
 
 		 488 aa  52  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  28.91 
 
 		 482 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  29.69 
 
 		 489 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1195  PilT protein-like  34.19 
 
 		 359 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2736  PilT protein domain protein  31.65 
 
 		 363 aa  52.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000848618  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  28.74 
 
 		 472 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  29.05 
 
 		 322 aa  52  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  28.48 
 
 		 485 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00910  PilT protein domain protein  33.09 
 
 		 364 aa  52  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000274223  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  33.6 
 
 		 311 aa  52.4  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  33.61 
 
 		 408 aa  52  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  28.91 
 
 		 477 aa  52  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  29.3 
 
 		 455 aa  51.6  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  32.68 
 
 		 438 aa  51.6  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  30.53 
 
 		 441 aa  51.6  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  29.05 
 
 		 322 aa  52  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  30.16 
 
 		 488 aa  51.6  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  29.6 
 
 		 492 aa  51.2  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  28.74 
 
 		 472 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  29.37 
 
 		 491 aa  51.2  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  30.85 
 
 		 491 aa  51.2  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  28.91 
 
 		 433 aa  51.2  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  30.88 
 
 		 449 aa  51.2  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  29.37 
 
 		 491 aa  51.2  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  28.91 
 
 		 484 aa  51.2  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  30.97 
 
 		 408 aa  51.2  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4206  type II secretion system protein E  29.66 
 
 		 621 aa  50.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  28.91 
 
 		 490 aa  50.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  30.47 
 
 		 476 aa  50.8  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  25.6 
 
 		 462 aa  50.8  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  28.49 
 
 		 322 aa  50.8  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  30.16 
 
 		 478 aa  50.8  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  31.82 
 
 		 459 aa  50.8  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  28.24 
 
 		 467 aa  50.4  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  28.91 
 
 		 467 aa  50.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  28.24 
 
 		 466 aa  50.4  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  29.24 
 
 		 460 aa  50.8  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  28.66 
 
 		 455 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  29.86 
 
 		 343 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0393  PilT protein domain protein  31.62 
 
 		 388 aa  50.4  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182305  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  28.66 
 
 		 455 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  28.66 
 
 		 455 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  30.08 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  24.89 
 
 		 404 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>