More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1561 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  100 
 
 		 509 aa  988    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  45.4 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  47 
 
 		 455 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  47.69 
 
 		 451 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  45.31 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  46.57 
 
 		 459 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  47.63 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  47.52 
 
 		 474 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  47.63 
 
 		 474 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  45.38 
 
 		 457 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  46.34 
 
 		 476 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  46.54 
 
 		 478 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  45.67 
 
 		 473 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  46.32 
 
 		 478 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  46.32 
 
 		 478 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  46.32 
 
 		 478 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.43 
 
 		 472 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  46.32 
 
 		 478 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  45.12 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  46.32 
 
 		 478 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  45.55 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  46.32 
 
 		 478 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  44.98 
 
 		 467 aa  363  4e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  43.42 
 
 		 514 aa  362  8e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  45.69 
 
 		 473 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 		 451 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 447 aa  307  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  45.67 
 
 		 398 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  39.35 
 
 		 477 aa  288  2e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  39.07 
 
 		 473 aa  269  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  34.89 
 
 		 399 aa  259  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  34.22 
 
 		 399 aa  257  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 		 435 aa  256  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  34.22 
 
 		 399 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  34.22 
 
 		 399 aa  256  6e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  34.22 
 
 		 399 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  34.22 
 
 		 399 aa  256  6e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  34.22 
 
 		 399 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  34.22 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  34.22 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 		 445 aa  250  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  35.26 
 
 		 485 aa  249  7e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  33.4 
 
 		 459 aa  249  9e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 		 539 aa  246  9e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 398 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  37.13 
 
 		 447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  34.89 
 
 		 456 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.11 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 465 aa  230  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  35.02 
 
 		 449 aa  226  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  32.69 
 
 		 464 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  33.62 
 
 		 436 aa  219  8.999999999999998e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  33.62 
 
 		 436 aa  219  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 436 aa  216  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  29.8 
 
 		 526 aa  216  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 		 459 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.97 
 
 		 468 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.05 
 
 		 462 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  29.47 
 
 		 456 aa  209  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 		 473 aa  206  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.2 
 
 		 470 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  31.29 
 
 		 438 aa  206  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 466 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.58 
 
 		 450 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 437 aa  204  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 382 aa  202  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 462 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 462 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 438 aa  199  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 479 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 462 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 459 aa  196  9e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 470 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 430 aa  194  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  28.03 
 
 		 388 aa  194  4e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 437 aa  192  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.65 
 
 		 461 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 467 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 461 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.09 
 
 		 462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  31.16 
 
 		 478 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  32.08 
 
 		 468 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  32.08 
 
 		 468 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  32.01 
 
 		 474 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  32.01 
 
 		 474 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  32.01 
 
 		 468 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  32.01 
 
 		 468 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  32.01 
 
 		 468 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>