More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7408 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 501 aa  963    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  84.85 
 
 		 501 aa  746    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  68.69 
 
 		 500 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  68.35 
 
 		 507 aa  512  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2373  carbohydrate kinase, YjeF related protein  66.53 
 
 		 507 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2650  carbohydrate kinase, YjeF related protein  66.13 
 
 		 507 aa  498  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  57.67 
 
 		 499 aa  486  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  56.91 
 
 		 499 aa  488  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  56.85 
 
 		 499 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  56.6 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  57.23 
 
 		 519 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  55.83 
 
 		 499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.86 
 
 		 510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.96 
 
 		 522 aa  442  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.97 
 
 		 496 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3313  carbohydrate kinase, YjeF related protein  57.55 
 
 		 499 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  52.09 
 
 		 493 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2229  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.13 
 
 		 538 aa  430  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.5 
 
 		 508 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  50.3 
 
 		 501 aa  413  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  50.3 
 
 		 501 aa  413  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1387  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.37 
 
 		 490 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.91 
 
 		 500 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.3 
 
 		 539 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.86 
 
 		 490 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.72 
 
 		 490 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1546  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.7 
 
 		 496 aa  352  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157969  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.12 
 
 		 485 aa  341  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1837  yjeF related protein  47.82 
 
 		 523 aa  334  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0048  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.59 
 
 		 468 aa  316  7e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  38.76 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1517  YjeF-related protein-like  41.59 
 
 		 581 aa  301  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126424 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1024  YjeF-related protein-like  44.76 
 
 		 528 aa  293  7e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  36.94 
 
 		 466 aa  291  2e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4460  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.06 
 
 		 509 aa  287  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1547  hypothetical protein  49.13 
 
 		 526 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.831986  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1332  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.89 
 
 		 476 aa  273  6e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.977936  normal  0.520853 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4659  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.83 
 
 		 457 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3322  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.25 
 
 		 492 aa  257  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.08 
 
 		 499 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.09 
 
 		 530 aa  248  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.71 
 
 		 531 aa  238  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.53 
 
 		 513 aa  237  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  34.56 
 
 		 517 aa  238  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.62 
 
 		 528 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.66 
 
 		 531 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.25 
 
 		 525 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.77 
 
 		 515 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.57 
 
 		 524 aa  231  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  36.18 
 
 		 514 aa  231  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  41.85 
 
 		 531 aa  229  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 510 aa  229  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  36.73 
 
 		 519 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.33 
 
 		 533 aa  228  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.21 
 
 		 521 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.21 
 
 		 509 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  37.55 
 
 		 496 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.46 
 
 		 499 aa  224  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.3 
 
 		 490 aa  223  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.36 
 
 		 514 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.48 
 
 		 524 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.54 
 
 		 511 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.3 
 
 		 533 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1191  YjeF-related protein-like protein  40.65 
 
 		 449 aa  219  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  34.97 
 
 		 524 aa  219  7e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.33 
 
 		 520 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  36.08 
 
 		 522 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  40.55 
 
 		 502 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  38.16 
 
 		 530 aa  214  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.26 
 
 		 500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  39.87 
 
 		 535 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.47 
 
 		 498 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.01 
 
 		 519 aa  213  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  38.31 
 
 		 496 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.91 
 
 		 519 aa  212  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  39.29 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.9 
 
 		 524 aa  211  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  39.1 
 
 		 499 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  38.62 
 
 		 507 aa  210  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.82 
 
 		 521 aa  210  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 502 aa  210  6e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.64 
 
 		 532 aa  209  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.71 
 
 		 490 aa  207  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  38.75 
 
 		 526 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  31.16 
 
 		 490 aa  206  8e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  40.12 
 
 		 500 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.26 
 
 		 556 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  32.27 
 
 		 498 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.25 
 
 		 517 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.53 
 
 		 492 aa  202  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.61 
 
 		 479 aa  202  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.23 
 
 		 515 aa  201  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.43 
 
 		 533 aa  200  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.82 
 
 		 556 aa  200  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.57 
 
 		 504 aa  200  6e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  34.58 
 
 		 486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.5 
 
 		 513 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  34.39 
 
 		 488 aa  196  6e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.14 
 
 		 524 aa  196  7e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  36.6 
 
 		 496 aa  196  9e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>