More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2970 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2970  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 106 aa  218  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0152756  decreased coverage  0.00683869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1810  LysR family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2292  LysR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 288 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000123532  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0997  LysR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 310 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1813  transcriptional regulator, LysR family  50.65 
 
 		 288 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139203  normal  0.0296636 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2531  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 288 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.389044  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2430  LysR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 288 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2538  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 288 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2653  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 288 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.66408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2221  LysR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 288 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572523  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2297  LysR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 288 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252143  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37930  LysR family transcriptional regulator protein  54.79 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3293  LysR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1370  transcriptional regulator, LysR family  44.19 
 
 		 313 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2560  transcriptional regulator, LysR family protein  58.46 
 
 		 299 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2875  LysR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 289 aa  70.5  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412762 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3156  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.53 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46065  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0817  transcriptional regulator, LysR family  41.03 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3436  LysR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0958  transcriptional regulator, LysR family  41.03 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.181705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  48.53 
 
 		 327 aa  67.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  43.28 
 
 		 306 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1337  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.89 
 
 		 290 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.449997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3476  LysR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239218 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3441  transcriptional regulator, LysR family  50.7 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2954  transcriptional regulator, LysR family  53.33 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000398128  unclonable  0.0000000375451 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0697  LysR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.191439  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3635  LysR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287506  normal  0.0415744 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06732  transcriptional regulator  47.95 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  42.31 
 
 		 309 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2364  regulatory protein, LysR  52.78 
 
 		 304 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 		 308 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0274  LysR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 305 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1745  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.61 
 
 		 317 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.307823  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2377  LysR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 294 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3287  DNA-binding transcriptional regulator CynR  47.76 
 
 		 299 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0362  DNA-binding transcriptional regulator CynR  47.76 
 
 		 299 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1936  transcriptional regulator, LysR family  38.89 
 
 		 262 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0403  DNA-binding transcriptional regulator CynR  47.76 
 
 		 299 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  47.06 
 
 		 299 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  47.06 
 
 		 299 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3322  transcriptional regulator, LysR family  42.35 
 
 		 296 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151906  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0989  transcriptional regulator, LysR family  37.18 
 
 		 307 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0866  transcriptional regulator, LysR family  37.18 
 
 		 307 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0369  DNA-binding transcriptional regulator CynR  47.06 
 
 		 299 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  47.06 
 
 		 299 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3406  transcriptional regulator, LysR family  38.89 
 
 		 262 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  44.12 
 
 		 301 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0411  DNA-binding transcriptional regulator CynR  47.76 
 
 		 299 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3960  LysR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 320 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.583838  normal  0.331614 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00774  transcriptional regulator, LysR family protein  41.05 
 
 		 330 aa  63.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2994  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 314 aa  63.5  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.735848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4360  LysR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623991  normal  0.557987 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1749  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1271  LysR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  43.48 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0158  LysR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02985  DNA-binding transcriptional activator  44.62 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0585  transcriptional regulator, LysR family  44.62 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3414  DNA-binding transcriptional activator TdcA  44.62 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02936  hypothetical protein  44.62 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2312  LysR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3899  transcriptional regulator, LysR family  47.89 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0580  DNA-binding transcriptional activator TdcA  44.62 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3592  DNA-binding transcriptional activator TdcA  44.62 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2775  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3239  DNA-binding transcriptional activator TdcA  44.62 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000824  transcriptional regulator LysR family  45.21 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00283098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4431  DNA-binding transcriptional activator TdcA  44.62 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0908114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0912  LysR family transcriptional regulator  45 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.990881  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4653  LysR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.519057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1309  LysR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1394  LysR family transcriptional regulator  45 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3306  DNA-binding transcriptional activator TdcA  44.62 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180291  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 296 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0958  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 297 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2158  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 300 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0300496  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2291  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 300 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3712  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 304 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2036  transcriptional regulator, LysR family  39.44 
 
 		 262 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39512  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  41.67 
 
 		 305 aa  61.6  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1305  LysR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 307 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2099  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 300 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0106  LysR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 283 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0531  LysR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 290 aa  61.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3362  LysR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0184586  normal  0.124308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0912  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 303 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 300 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2280  transcriptional regulator, LysR family  36.56 
 
 		 305 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0909  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40 
 
 		 298 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  43.66 
 
 		 298 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2293  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 301 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  44.44 
 
 		 304 aa  60.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3699  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.24 
 
 		 297 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.792839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>