More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2312 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2312  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 332 aa  656    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2480  LysR family transcriptional regulator  58.99 
 
 		 319 aa  361  9e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228545  normal  0.0166786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2019  LysR family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 309 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3896  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701022  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2790  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2898  transcriptional regulator, LysR family  43.71 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.373982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1708  Transcriptional regulator-like protein  41.07 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0615  transcriptional regulator, LysR family  37.78 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7146  transcriptional regulator, LysR family  35.94 
 
 		 319 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3515  LysR family regulatory protein  34.49 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2902  transcriptional regulator, LysR family  35.17 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.187711  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0550  transcriptional regulator, LysR family  36.83 
 
 		 329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1442  transcriptional regulator, LysR family  34.52 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.200576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  33.99 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 302 aa  99.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2030  LysR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 290 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 290 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3362  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 301 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0184586  normal  0.124308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 293 aa  96.7  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  33.69 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2173  transcriptional regulator, LysR family  27.62 
 
 		 308 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  31.17 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  31.62 
 
 		 306 aa  94  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 303 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  31.62 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  30.83 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  30.83 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  30.83 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  30.83 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  30.83 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4974  transcriptional regulator, LysR family  36.16 
 
 		 301 aa  93.2  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  31.18 
 
 		 296 aa  93.2  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1447  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 316 aa  92.4  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 300 aa  92.8  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6552  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 303 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.392727 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5704  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 303 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6068  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 303 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  27.36 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 297 aa  92.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_003296  RS03179  transcription regulator protein  31.4 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379949  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1026  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  29.92 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  30.68 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0746  transcriptional regulator, LysR family  35.27 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 295 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0999  transcriptional regulator CatR  30.68 
 
 		 304 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  31.44 
 
 		 327 aa  90.5  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 315 aa  90.5  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  30.83 
 
 		 304 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4628  transcriptional regulator, LysR family  29.86 
 
 		 292 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0890971  normal  0.246233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 296 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 300 aa  89.7  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 308 aa  89.4  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3441  transcriptional regulator, LysR family  28 
 
 		 297 aa  89.4  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5135  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 296 aa  89.4  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1028  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1156  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  31.1 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  32.09 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2326  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1342  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 295 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  30.04 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3524  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.76062  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0380  transcriptional regulator LysR family  31.76 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>