More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2480 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2480  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 319 aa  642    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228545  normal  0.0166786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2312  LysR family transcriptional regulator  58.99 
 
 		 332 aa  361  8e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2019  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 309 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1708  Transcriptional regulator-like protein  38.17 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3896  LysR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701022  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2790  transcriptional regulator, LysR family  38.98 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2898  transcriptional regulator, LysR family  44.12 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.373982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2902  transcriptional regulator, LysR family  39.29 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.187711  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3515  LysR family regulatory protein  32.7 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0615  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7146  transcriptional regulator, LysR family  33.75 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0550  transcriptional regulator, LysR family  33.23 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  29.89 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1447  transcriptional regulator, LysR family  32.82 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  32.6 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 300 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 300 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 303 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  29.08 
 
 		 295 aa  93.6  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  33.19 
 
 		 295 aa  93.2  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  32.71 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  27.56 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  28.86 
 
 		 294 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1053  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 310 aa  89.4  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262564  normal  0.905939 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6552  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 303 aa  89.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.392727 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5704  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 303 aa  89.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6068  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 303 aa  89.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 298 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  30.38 
 
 		 308 aa  89  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0380  transcriptional regulator LysR family  34.45 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3524  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.76062  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  29.86 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  29.86 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  29.84 
 
 		 343 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2231  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.392595  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  32.17 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 291 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1342  LysR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318091  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  27.64 
 
 		 302 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 306 aa  85.9  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 291 aa  85.9  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1380  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1442  transcriptional regulator, LysR family  29.33 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.200576 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  27.35 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3404  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.729223  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2030  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0617  transcriptional regulator, LysR family  30.04 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5518  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593502  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4628  transcriptional regulator, LysR family  31.56 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0890971  normal  0.246233 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3534  LysR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4518  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0020  LysR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0746  transcriptional regulator, LysR family  33.04 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2649  transcriptional regulator  27.76 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1538  LysR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.337495  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1756  LysR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.497412  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0390  transcriptional regulator, LysR family  32.86 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2782  LysR family regulatory protein  28.7 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105762  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2265  LysR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503277  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3053  LysR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1250  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0513927 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5069  LysR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5454  LysR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533779  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3664  transcriptional regulator, LysR family  32.23 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4621  LysR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0988877  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1654  hydrogen peroxide-inducible genes activator  27.8 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00724333  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0520  hydrogen peroxide-inducible genes activator  27.8 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.454545  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3128  transcriptional regulator, LysR family  29.19 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5135  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  29.31 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1028  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  27.9 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>