More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0550 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0550  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 329 aa  650    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3515  LysR family regulatory protein  38.17 
 
 		 318 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1708  Transcriptional regulator-like protein  38.39 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2902  transcriptional regulator, LysR family  36.83 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.187711  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0615  transcriptional regulator, LysR family  37.3 
 
 		 327 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2019  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3896  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701022  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2312  LysR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7146  transcriptional regulator, LysR family  33.54 
 
 		 319 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2480  LysR family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 319 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228545  normal  0.0166786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2790  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 		 330 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  34.38 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0380  transcriptional regulator LysR family  34.87 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3404  LysR family transcriptional regulator  32.36 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.729223  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4628  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0890971  normal  0.246233 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6619  transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  34.75 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2554  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0664958  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 303 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 303 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  34.25 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2608  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 		 301 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 294 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0486  transcriptional regulator CatR  32.39 
 
 		 295 aa  96.7  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 295 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1250  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0513927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2898  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 316 aa  96.3  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.373982 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  28 
 
 		 292 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  31.5 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3509  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633276 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  31.91 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  31.91 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  31.91 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  31.91 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  30 
 
 		 292 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 305 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  30 
 
 		 292 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  30 
 
 		 292 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 300 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2326  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 306 aa  93.6  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 300 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.96 
 
 		 296 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0985  transcriptional regulator CatR  31.56 
 
 		 295 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  31.56 
 
 		 295 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  31.56 
 
 		 295 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1342  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 302 aa  92.4  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318091  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 		 295 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 296 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 299 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 302 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2704  LysR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.995424  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  31.37 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1050  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1352  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 305 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4044  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.114171 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  33.47 
 
 		 343 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1036  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2649  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.98 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  30.98 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2265  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 300 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503277  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2231  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.392595  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1756  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 300 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.497412  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  30.98 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2782  LysR family regulatory protein  32.17 
 
 		 300 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 297 aa  90.5  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3053  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 300 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1538  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 300 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.337495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>