More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2019 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2019  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  598  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2790  transcriptional regulator, LysR family  48.72 
 
 		 330 aa  248  9e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2480  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 319 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228545  normal  0.0166786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3896  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701022  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2312  LysR family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 332 aa  212  7.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1708  Transcriptional regulator-like protein  40.26 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7146  transcriptional regulator, LysR family  39.81 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0615  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 		 327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2902  transcriptional regulator, LysR family  36.74 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.187711  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3515  LysR family regulatory protein  36.57 
 
 		 318 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0550  transcriptional regulator, LysR family  38.51 
 
 		 329 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2898  transcriptional regulator, LysR family  39.55 
 
 		 316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.373982 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 290 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 290 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 302 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3404  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 293 aa  99  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.729223  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  31.88 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3471  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 305 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  33.48 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2326  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 306 aa  96.7  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  32.36 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0520  hydrogen peroxide-inducible genes activator  29.32 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.454545  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1654  hydrogen peroxide-inducible genes activator  29.32 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00724333  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  32.94 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4628  transcriptional regulator, LysR family  32.16 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0890971  normal  0.246233 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 331 aa  90.1  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 301 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1447  transcriptional regulator, LysR family  34.31 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  32.61 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0380  transcriptional regulator LysR family  33.21 
 
 		 309 aa  86.7  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  35.78 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0927  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 303 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  35.32 
 
 		 304 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 306 aa  85.9  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 316 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  27.03 
 
 		 292 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 327 aa  85.5  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3084  transcriptional regulator, LysR family  31.17 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2332  transcriptional regulator, LysR family  28.06 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194223  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2554  transcriptional regulator, LysR family  32.03 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0664958  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1969  transcriptional regulator, LysR family  28.06 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0186  transcriptional regulator, LysR family  30.89 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.925738  normal  0.858916 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1028  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3534  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3915  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4518  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  32.46 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4722  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1442  transcriptional regulator, LysR family  31.64 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.200576 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0334  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  30.68 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1650  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0727  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.849989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  29.24 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.37 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1374  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1380  LysR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>