More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3896 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3896  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  639    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701022  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1708  Transcriptional regulator-like protein  58.54 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2019  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2312  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2790  transcriptional regulator, LysR family  40.65 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2480  LysR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228545  normal  0.0166786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2902  transcriptional regulator, LysR family  35.87 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.187711  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0615  transcriptional regulator, LysR family  34.18 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3515  LysR family regulatory protein  31.75 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7146  transcriptional regulator, LysR family  33.12 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0550  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 329 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2898  transcriptional regulator, LysR family  34.72 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.373982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  30.31 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 291 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 291 aa  89  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  29.44 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1447  transcriptional regulator, LysR family  27.69 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 290 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 301 aa  85.9  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3362  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0184586  normal  0.124308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.94 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2326  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  27.89 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2231  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.392595  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  26.59 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  28.28 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3524  LysR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.76062  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3223  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042632  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1243  transcriptional regulator, LysR family  28.32 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.0485343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  28.88 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  28.36 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0147  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3766  transcriptional regulator, LysR family  33.16 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.763855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  27.56 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1442  transcriptional regulator, LysR family  29.6 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.200576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2030  LysR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  27.55 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2574  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3143  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4244  LysR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1855  LysR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0671  LysR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5081  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12212 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4461  LysR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3915  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4981  LysR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  28.46 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5704  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0066  transcriptional regulator, LysR family  26.74 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3126  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6552  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.392727 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6068  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3293  LysR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  30.13 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0276  transcriptional regulator, LysR family  27.78 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3509  LysR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2663  LysR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1156  LysR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2261  transcriptional regulator MetR  27.82 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0767  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.38 
 
 		 306 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2962  LysR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478402  normal  0.502508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>