More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3223 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3223  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042632  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3552  LysR family transcriptional regulator  62.67 
 
 		 297 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1183  LysR family transcriptional regulator  62.67 
 
 		 297 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0687  LysR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2993  LysR family transcriptional regulator  61.38 
 
 		 319 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3097  transcriptional regulator, LysR family  58.47 
 
 		 319 aa  354  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3205  LysR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 314 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0606  LysR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 305 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3989  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0119211  normal  0.0654574 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3862  LysR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 341 aa  259  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.910956  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3838  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3527  LysR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0804  LysR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0738  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3703  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0498  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282116  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2313  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 327 aa  162  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.344655  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1471  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1510  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 276 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0433683  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0157  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1342  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318091  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0307  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  29.05 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4305  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.201551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 293 aa  136  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  31.06 
 
 		 293 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5843  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271378 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3084  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3013  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7451  putative transcriptional regulator  30.48 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193814  normal  0.890359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  31.47 
 
 		 298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 291 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3404  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 293 aa  125  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.729223  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  30.45 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 289 aa  125  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  29.35 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0617  transcriptional regulator, LysR family  31.52 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 298 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0038  transcriptional regulator, LysR family  30.95 
 
 		 300 aa  123  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.744574 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  29.62 
 
 		 296 aa  123  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0037  transcriptional regulator, LysR family  30.95 
 
 		 300 aa  123  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.279269  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0834  transcriptional regulator, LysR family  32.25 
 
 		 300 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0152  transcriptional regulator, LysR family  28.28 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1672  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 304 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.57 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  30.3 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  32.08 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0578  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4628  transcriptional regulator, LysR family  31.94 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0890971  normal  0.246233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0946  transcriptional regulator, LysR family  27.65 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0379301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4923  LysR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  34.38 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2932  DNA-binding transcriptional activator XapR  28.22 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000456471  normal  0.0988351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5074  transcriptional regulator, LysR family  29.33 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.507053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 296 aa  116  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1900  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  27.59 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  30 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0551  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.863373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  27.59 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  27.59 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4639  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>