More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1708 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1708  Transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 321 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3896  LysR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 316 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701022  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2480  LysR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228545  normal  0.0166786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2019  LysR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 309 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2312  LysR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2902  transcriptional regulator, LysR family  36.08 
 
 		 321 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.187711  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3515  LysR family regulatory protein  34.62 
 
 		 318 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0550  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2790  transcriptional regulator, LysR family  35.41 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0615  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 327 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7146  transcriptional regulator, LysR family  32.91 
 
 		 319 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2898  transcriptional regulator, LysR family  34.64 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.373982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  29.62 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1447  transcriptional regulator, LysR family  29.28 
 
 		 316 aa  89.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3362  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 301 aa  89  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0184586  normal  0.124308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3891  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314742  normal  0.132364 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2231  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 298 aa  86.3  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.392595  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 351 aa  85.9  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03179  transcription regulator protein  25.85 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379949  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2486  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  30.08 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  29.71 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0147  LysR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  29.65 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4628  transcriptional regulator, LysR family  28.85 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0890971  normal  0.246233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  27.02 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  29.72 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  29.49 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  29.49 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  29.49 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  31.4 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2173  transcriptional regulator, LysR family  28 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  30.13 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1380  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8824  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0242  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  32.61 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4722  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2030  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3509  LysR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633276 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3296  StmR  27.54 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.618402 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2148  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5135  LysR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7124  transcriptional regulator, LysR family  28.01 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  21.63 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  29.06 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1442  transcriptional regulator, LysR family  30.91 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.200576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0390  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.11 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  32.38 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3111  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.08 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2265  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2155  LysR family substrate binding transcriptional regulator  28.92 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.971753  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0369  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.86 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1156  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2373  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0629728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0403  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.79 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0362  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.79 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3287  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.4 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  25.33 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  31.22 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1026  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4431  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3275  transcriptional regulator, LysR family  27.59 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0115346  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6552  LysR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.392727 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5704  LysR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1449  LysR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4103  LysR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348034 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6068  LysR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  27.14 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  28.79 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3076  LysR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>