More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2898 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2898  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 316 aa  604  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.373982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2312  LysR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 332 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2480  LysR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 319 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228545  normal  0.0166786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2790  transcriptional regulator, LysR family  35.56 
 
 		 330 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2019  LysR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 309 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1708  Transcriptional regulator-like protein  38.03 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3896  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701022  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2902  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.187711  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0550  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0615  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3515  LysR family regulatory protein  32.53 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7146  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  28.43 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5069  LysR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5454  LysR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1442  transcriptional regulator, LysR family  34.05 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.200576 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0380  transcriptional regulator LysR family  29.58 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5335  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  31.47 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  28.36 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  24.36 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5341  transcriptional regulator, LysR family  25.42 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4914  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  29.66 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5012  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5392  transcriptional regulator, LysR family  25.42 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  29.37 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  31.47 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  31.06 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0186  transcriptional regulator, LysR family  28.93 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.925738  normal  0.858916 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  29.61 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3612  LysR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.11328  normal  0.0439826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  30.53 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5310  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1453799999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6254  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3577  transcriptional regulator, LysR family  38.04 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0937432  normal  0.112769 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  32.3 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4461  LysR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1969  transcriptional regulator, LysR family  27.5 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2332  transcriptional regulator, LysR family  27.5 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194223  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1356  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  0.0413241 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4027  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2663  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  32.17 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3495  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563303 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2173  transcriptional regulator, LysR family  44.57 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3441  transcriptional regulator, LysR family  26.79 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  28.9 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1978  LysR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal  0.0418865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2069  LysR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4103  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348034 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  24.9 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1121  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  24.9 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1380  LysR family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08730  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.188975 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1358  transcriptional regulator, LysR family  39.24 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4518  LysR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4455  LysR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246938 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3534  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0222  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4981  LysR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1374  LysR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1408  LysR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4246  transcriptional regulator, LysR family  33.49 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20222  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  29.96 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5534  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162022  normal  0.470463 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4197  LysR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0954  transcriptional regulator, LysR family  29.65 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0054169  hitchhiker  0.000000358715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>