More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A2036 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A2036  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
262 aa  528  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2015  LysR family transcriptional regulator  96.18 
 
 
262 aa  510  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.253751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1936  transcriptional regulator, LysR family  92.72 
 
 
262 aa  498  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3406  transcriptional regulator, LysR family  89.31 
 
 
262 aa  477  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245138 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1754  LysR family transcriptional regulator  94.27 
 
 
262 aa  479  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.320328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1797  LysR family transcriptional regulator  93.51 
 
 
262 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.103714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1771  LysR family transcriptional regulator  93.51 
 
 
262 aa  477  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.222111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1972  transcriptional regulator, LysR family  93.51 
 
 
262 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000282525 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1937  LysR family transcriptional regulator  93.13 
 
 
262 aa  474  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1749  LysR family transcriptional regulator  71.76 
 
 
262 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2056  HTH-type transcriptional regulator GltR  33.33 
 
 
285 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0247  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 
288 aa  92  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  26.74 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0205  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0208  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  30.33 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5097  transcriptional regulator, LysR family  30.33 
 
 
288 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0230  transcriptional regulator, LysR family  30.33 
 
 
288 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0188  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
288 aa  89.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  26.74 
 
 
283 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46170  LysR family transcriptional regulator  26.34 
 
 
290 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0324298 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  27.31 
 
 
283 aa  89  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6389  LysR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
291 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0907959  normal  0.0995777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3511  LysR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
283 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2781  LysR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
329 aa  88.2  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5516  LysR family transcriptional regulator  25.27 
 
 
291 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0587498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2203  LysR family transcriptional regulator  45.37 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.460556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5880  LysR family transcriptional regulator  25.27 
 
 
291 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311857  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3926  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 
290 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  25.45 
 
 
325 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3267  LysR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
283 aa  85.9  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3297  LysR family transcriptional regulator  47.13 
 
 
283 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3211  LysR family transcriptional regulator  47.13 
 
 
283 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3557  LysR family transcriptional regulator  47.13 
 
 
283 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.423553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3514  transcriptional regulator, LysR family  47.13 
 
 
283 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3677  transcriptional regulator, LysR family  22.78 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1974  transcriptional regulator, LysR family  23.55 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601585  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3213  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.146504  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0071  putative transcriptional regulator LysR-type  24.72 
 
 
292 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120497  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4564  LysR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53731  normal  0.180488 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0554  transcriptional regulator LysR family  26.14 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0936885  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1905  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.204877 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0121  transcriptional regulator, LysR family  25.73 
 
 
304 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0214  transcription regulator protein  24.08 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5127  LysR family transcriptional regulator  47.73 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7214  LysR family transcriptional regulator  23.37 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447875  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0486  LysR substrate-binding  23.43 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3818  LysR family transcriptional regulator  23.64 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.173651 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2660  LysR family transcriptional regulator  24.66 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2410  transcriptional regulator, LysR family  25.21 
 
 
287 aa  79  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.975942  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1413  transcriptional regulator, LysR family  27.23 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.258464  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0928  LysR family transcriptional regulator  23.87 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  25.17 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1410  LysR family transcriptional regulator  23.87 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.807333  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4525  LysR family transcriptional regulator  24.15 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0280  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1501  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.94 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1329  LysR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2646  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1385  LysR family transcriptional regulator  23.73 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134108  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1081  LysR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440964  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0272  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0189  LysR family transcriptional regulator  23.46 
 
 
300 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4032  LysR family transcriptional regulator  22.65 
 
 
297 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660064  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7296  LysR family transcriptional regulator  23.97 
 
 
309 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal  0.377846 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4554  LysR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
305 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0357  transcriptional regulator  43.18 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.449267  unclonable  0.0000000664485 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5069  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5454  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533779  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0208  transcriptional regulator, LysR family  23.67 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.502619  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26681  putative Rubisco transcriptional regulator  27.94 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0896  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0937961  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1817  hypothetical protein  29.19 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.504025  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1424  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
337 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0706  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
341 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.897426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1638  transcriptional regulator  29.19 
 
 
341 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0454  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
341 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.499714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1661  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
341 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5687  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1652  LysR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
299 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0547251  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1631  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
311 aa  75.5  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1558  LysR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2395  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.15 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0377245  normal  0.580313 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  25.62 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2398  putative Rubisco transcriptional regulator  27.53 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1388  LysR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.275315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4716  LysR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1290  LysR family transcriptional regulator  25.65 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1769  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0244764  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0804  transcription regulator protein  42.17 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.540321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1612  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0750  transcriptional regulator, LysR family  42.35 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1450  LysR family transcriptional regulator  23.55 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8516  transcriptional regulator, LysR family  43.9 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0258  LysR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>