More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2015 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_2015  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 262 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.253751  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2036  transcriptional regulator, LysR family  96.18 
 
 		 262 aa  510  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1936  transcriptional regulator, LysR family  92.72 
 
 		 262 aa  498  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3406  transcriptional regulator, LysR family  89.31 
 
 		 262 aa  476  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245138 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1797  LysR family transcriptional regulator  91.98 
 
 		 262 aa  471  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.103714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1771  LysR family transcriptional regulator  92.37 
 
 		 262 aa  472  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.222111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1754  LysR family transcriptional regulator  92.75 
 
 		 262 aa  473  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.320328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1972  transcriptional regulator, LysR family  92.37 
 
 		 262 aa  472  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000282525 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1937  LysR family transcriptional regulator  91.6 
 
 		 262 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1749  LysR family transcriptional regulator  72.14 
 
 		 262 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2056  HTH-type transcriptional regulator GltR  32.08 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0247  transcriptional regulator, LysR family  31.56 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  27.11 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  31.15 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0230  transcriptional regulator, LysR family  31.15 
 
 		 288 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5097  transcriptional regulator, LysR family  31.15 
 
 		 288 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0188  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 288 aa  92  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0205  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 288 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0208  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 288 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  27.11 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  26.89 
 
 		 283 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6389  LysR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0907959  normal  0.0995777 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2781  LysR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 329 aa  89.4  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3511  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 283 aa  89  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0554  transcriptional regulator LysR family  26.89 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0936885  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5516  LysR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0587498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2203  LysR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 287 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.460556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5880  LysR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311857  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3267  LysR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3211  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  25.86 
 
 		 322 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3297  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 283 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3514  transcriptional regulator, LysR family  27.62 
 
 		 283 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0071  putative transcriptional regulator LysR-type  25.83 
 
 		 292 aa  86.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3557  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 283 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.423553  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46170  LysR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 290 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0324298 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  26.16 
 
 		 325 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3213  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 283 aa  85.9  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.146504  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0214  transcription regulator protein  24.68 
 
 		 288 aa  85.5  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3677  transcriptional regulator, LysR family  23.4 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3926  putative transcriptional regulator  24.43 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4564  LysR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53731  normal  0.180488 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5127  LysR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7214  LysR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0121  transcriptional regulator, LysR family  25.94 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1905  LysR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.204877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1974  transcriptional regulator, LysR family  22.69 
 
 		 281 aa  82  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601585  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2660  LysR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26681  putative Rubisco transcriptional regulator  28.74 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0928  LysR family transcriptional regulator  24 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1410  LysR family transcriptional regulator  24 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.807333  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1329  LysR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0189  LysR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4554  LysR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2398  putative Rubisco transcriptional regulator  28.74 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0208  transcriptional regulator, LysR family  24.08 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.502619  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0896  LysR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0937961  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1817  hypothetical protein  24.78 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.504025  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7296  LysR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal  0.377846 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0295  putative Rubisco transcriptional regulator  28.63 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1413  transcriptional regulator, LysR family  27.12 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.258464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1424  LysR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0454  LysR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.499714  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0706  LysR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.897426  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0486  LysR substrate-binding  23.01 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1661  LysR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1638  transcriptional regulator  24.78 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5687  LysR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0272  LysR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2410  transcriptional regulator, LysR family  25.21 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.975942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0280  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1081  LysR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1290  LysR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109093  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1388  LysR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1501  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.94 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2646  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0146  LysR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01751  putative Rubisco transcriptional regulator  28.23 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1612  LysR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0357  transcriptional regulator  43.18 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.449267  unclonable  0.0000000664485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3818  LysR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 297 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.173651 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5069  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5454  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533779  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1652  LysR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0547251  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8516  transcriptional regulator, LysR family  43.9 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1312  LysR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0843658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1631  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0342  transcriptional regulator, LysR family  26.32 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55150  transcriptional regulator  22.92 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000391017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2823  transcriptional regulator, LysR family  24.44 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135524  normal  0.141091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4525  LysR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0804  transcription regulator protein  42.17 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.540321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2661  transcriptional regulator, LysR family  27.16 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.826395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>