More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1749 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1749  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 262 aa  530  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1936  transcriptional regulator, LysR family  72.9 
 
 		 262 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2015  LysR family transcriptional regulator  72.14 
 
 		 262 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.253751  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2036  transcriptional regulator, LysR family  71.76 
 
 		 262 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3406  transcriptional regulator, LysR family  71.76 
 
 		 262 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245138 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1797  LysR family transcriptional regulator  71.76 
 
 		 262 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.103714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1771  LysR family transcriptional regulator  72.52 
 
 		 262 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.222111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1754  LysR family transcriptional regulator  72.14 
 
 		 262 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.320328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1972  transcriptional regulator, LysR family  72.52 
 
 		 262 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000282525 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1937  LysR family transcriptional regulator  71.37 
 
 		 262 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2056  HTH-type transcriptional regulator GltR  30.47 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  27.07 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0247  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 288 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  26.32 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  26.69 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6389  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0907959  normal  0.0995777 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5880  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311857  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5516  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0587498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 288 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  29.54 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3213  LysR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 283 aa  93.2  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.146504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5097  transcriptional regulator, LysR family  29.54 
 
 		 288 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0230  transcriptional regulator, LysR family  29.54 
 
 		 288 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0188  LysR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 288 aa  92.4  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0205  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 288 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0208  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 288 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3677  transcriptional regulator, LysR family  25.53 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0554  transcriptional regulator LysR family  27.54 
 
 		 291 aa  90.1  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0936885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0486  LysR substrate-binding  26.89 
 
 		 298 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0214  transcription regulator protein  25.11 
 
 		 288 aa  89.7  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2203  LysR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 287 aa  89.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.460556  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3267  LysR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 283 aa  89.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3211  LysR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 283 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3297  LysR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 283 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3557  LysR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 283 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.423553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3514  transcriptional regulator, LysR family  26.14 
 
 		 283 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3511  LysR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 283 aa  89  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7214  LysR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 291 aa  89  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46170  LysR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 290 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0324298 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7296  LysR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal  0.377846 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2660  LysR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3926  putative transcriptional regulator  25.1 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0896  LysR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 321 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0937961  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1817  hypothetical protein  25.22 
 
 		 321 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.504025  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0454  LysR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.499714  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1424  LysR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1661  LysR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0706  LysR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.897426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1638  transcriptional regulator  25.22 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0357  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.449267  unclonable  0.0000000664485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2823  transcriptional regulator, LysR family  25.88 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135524  normal  0.141091 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1413  transcriptional regulator, LysR family  27.52 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.258464  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1312  LysR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0843658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0928  LysR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1329  LysR family transcriptional regulator  24 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1410  LysR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.807333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1905  LysR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.204877 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4554  LysR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0121  transcriptional regulator, LysR family  24.37 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0804  transcription regulator protein  28.57 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.540321 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0071  putative transcriptional regulator LysR-type  23.53 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120497  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  26.18 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0750  transcriptional regulator, LysR family  28.43 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0280  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1290  LysR family transcriptional regulator  23.25 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109093  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1388  LysR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4564  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53731  normal  0.180488 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5012  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1974  transcriptional regulator, LysR family  23.11 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601585  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  27.2 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2781  LysR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 329 aa  79  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1612  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 301 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  19.59 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  27.4 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0044  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5069  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0854  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.43 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5454  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533779  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1081  LysR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2919  LysR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.395037  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  27.05 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2646  LysR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2410  transcriptional regulator, LysR family  25.94 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.975942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0272  LysR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2395  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.42 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0377245  normal  0.580313 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0189  LysR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  27.4 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5341  transcriptional regulator, LysR family  27.5 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0208  transcriptional regulator, LysR family  25.41 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.502619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0820  transcriptional regulator, LysR family  27.98 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.194336 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5127  LysR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1652  LysR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0547251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 297 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4649  transcriptional activator  25.74 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 297 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>